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bbslover金虫 (正式写手)
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【求助】请教如何按照指定的形式对接？ 已有3人参与
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我看到文献中已经给出了他们做的对接模式，知道配体的相应原子与蛋白的结合模式，我如何重复他们的工作呢？ 可不可以按照他们得到的结合模型来指定特定的残基呢？ 我重复他们的工作的时候，对接得分很高，可是和他们用的同一个分子得到的结合模型不同啊？ 文献中有一句话， thsi new binding model necessitated revisiting the structure of the glycine-rich loop (P-loop) in the protein to avoid steric clashes between the P-loop and computationally modelled compounds. 这里说是不是受体蛋白首先要修改一下，然后再对接呢，那么p-loop指的是什么？ 谢谢！ |
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