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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】请大家帮忙gmx
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astringent

铜虫 (著名写手)

[交流] 【求助】请大家帮忙gmx 已有2人参与

做动力学模拟出现这个错误，
NOTE 1 [file md.mdp, line unknown]:
  The Berendsen thermostat does not generate the correct kinetic energy
  distribution. You might want to consider using the V-rescale thermostat.
该如何解决？可以忽略，继续算吗？还是必须解决才能往下进行？请大家帮忙分析一下，不甚感激
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1楼 2010-06-06 21:28:52
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zhuhongaaa

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-07 11:51:38
热浴不搞定的话，算的结果似乎就没什么意义了；
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分子模拟的主页http://varmilion.tk/
3楼2010-06-07 11:16:13
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gcl600754

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-07 10:37:14
这个主要看你的模拟体系了，不过最好还是把thermostat在md.mdp中修改一下吧，否则应该会对模拟结果有影响。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-06-07 08:31:25
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