24小时热门版块排行榜    

查看: 5875  |  回复: 15
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zjz660964

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【讨论】各种分子对接软件的速度和精度比较 已有13人参与

目前流行的分子对接软件很多,比如AutoDock,DOCK,FRED,Surflex,FlexX,Glide,GOLD,ICM,MVD等等,请大家分析一下各个软件在对接的精度以及速度方面的差异。那种软件速度最快?哪种精度最高?还有使用的难易程度的差别?
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子对接问题锦集 AutoDock问题汇总

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arthurii

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-05 19:01:23
曾经在某一个blog里面见过有人简单试用的写了一下心得,LZ可以去google一下
10楼2010-06-05 14:55:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

zhangdagou5858

银虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-30 08:43:43
对接的基本理论都差不多,所以差别应该不大
2楼2010-05-30 03:56:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cy2003

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-05-30 09:44:14
这个得区分一下吧,是柔性对接还是刚性对接软件?对接精度还与打分函数有关。虽然软件基本理论差不多,但用起来区别还是挺大的。
3楼2010-05-30 09:23:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

银光闪烁

新虫 (初入文坛)

共同探讨

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-05-31 16:01:52
用过MVD和AutoDock,别的没用过的不敢妄加评论

据文献说MVD对接精度挺高,高于Glide、Surflex、FlexX及GOLD,对接起来大概平均每个分子10分钟。

AutoDock使用更广泛,不过步骤比较复杂一点,对接速度也相应慢一些
4楼2010-05-31 14:17:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +3 gouxfjh 2026-08-28 3/150 2026-08-29 01:01 by jurkat.1640
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-29 00:28 by winsaint
[基金申请] 国自然评审意见 +11 wangmingqi 2026-08-28 15/750 2026-08-29 00:17 by fangyl2005
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
请填处理意见