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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】NAMD中的一个问题？
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jianchaoyv

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】NAMD中的一个问题？ 已有2人参与

请问在.conf中设置的压强值与利用.log中求平均计算的压强值相差较大，比如：设置的压强为7750个大气压，而求平均得到的是7883个大气压。请问怎样减小这样的差值？在进行下一步计算时是用设定那个压强值还是用求平均得到那个压强值？
是不是增加模拟时间会减小这样的误差啊？
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1楼 2010-05-26 15:29:46
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-26 16:00:26
因为计算方法的问题,压强的波动很大
差个几百上千个大气压很正常
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2楼2010-05-26 15:57:46
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jianchaoyv

金虫 (小有名气)
请问楼上的那么再计算其他量时应该用设定那个还是用求平均那个值？
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3楼2010-05-26 20:25:11
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