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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】有关em.mdp文件
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astringent

铜虫 (著名写手)

[交流] 【求助】有关em.mdp文件 已有4人参与

弱弱问一下，用gromacs做模拟时，em.mdp文件是自己输入的吗？还是有现成的脚本啊，请大家赐教，不胜感激
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1楼 2010-05-09 20:28:40
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青青白白123

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhuhongaaa at 2010-05-11 23:06:11
去看看这个。
http://zhuhong.freetzi.com/wordpress/?p=45

您好，链接能不能重新给一下啊？谢谢
赞一下 回复此楼
5楼2018-01-11 09:18:42
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-05-10 08:21:40
gromacs的mdp都是些设置参数的东西，拿别人的改改也行，自己照说明书写也行
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-05-09 20:46:15
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sinokang

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-05-10 09:43:14
.mdp文件是分子动态参数文件，也就是计算控制文件，包含分子动态仿真的所有信息如时间，温度，压力等等，很多东西需要自己设定，可以自己根据手册编写，也可以用别人但需要修改一些参数
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-05-10 09:28:55
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zhuhongaaa

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-12 10:05:13
去看看这个。
http://zhuhong.freetzi.com/wordpress/?p=45
赞一下(2人) 回复此楼
分子模拟的主页http://varmilion.tk/
4楼2010-05-11 23:06:11
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