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【讨论】PCR-DGGE
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【讨论】PCR-DGGE
已有1人参与
问个问题哈,向大家。我采用PCR-DGGE的方法从土壤中提取的总DNA中获得了电泳图,有几条条带,那么是否可以对每个条带的DNA再测序来知道这个条带主要是什么菌呢?用什么方法?
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1楼
2010-05-08 08:47:44
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ygbxk
铁杆木虫
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性别: GG
专业: 环境地球化学
★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
DGGE后出来的条带可以进行测序,但是不一定是单一菌种的,因为DGGE只对不同长度的PCR产物进行分离,长度一样的可能就分离不出来了。我一般采用两种方法,一是DGGE割胶纯化,对目的条带割胶后再用DGGE纯化得到单一条带后再直接测序,但是这个方法比较麻烦,操作不好的话还很容易污染;再一个就是对割胶产物进行克隆然后测序,也不简单呵呵。
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2楼
2010-05-08 12:32:31
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