24小时热门版块排行榜    

查看: 1676  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】在sybyl里如何批量加氢? 已有4人参与

有一百多个未加氢分子,现倒入到SYBYL里,全部没有加氢,请问有没有方法或是命令可以批量加氢呢?

    请懂得的人不吝赐教~~
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

绿茶QJM

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by piscesee at 2010-05-02 19:47:19:
把这些分子先放到一个database里
在sybyl里以Update的方式打开这个数据库
再在终端里输入
for mol in %database(*)
database get "$mol" M1
fillvalence M1 H
database add "M1" repla ...

刚试过以上命令,get "$mol" M1不能识别,is invalid or ambiguious.偶以前通常用的都是图形界面,在这方面没有什么常识,能否详讲下~~
6楼2010-05-04 10:15:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

piscesee

铁杆木虫 (正式写手)

应该可以,我试试啊
2楼2010-04-30 19:40:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-01 08:44
自己录个宏就可以啊,也就是所谓的 spl 脚本?
3楼2010-04-30 21:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-02 18:31
用SPL语言编写,然后用命令行读取,即可,具体操作看SYBYL手册。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2010-05-01 23:08:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 化学工程321分求调剂 +14 大米饭! 2026-03-15 17/850 2026-03-18 12:40 by Linda Hu
[考研] 一志愿中国海洋大学,生物学,301分,求调剂 +3 1孙悟空 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:28 by macy2011
[考研] 268求调剂 +6 简单点0 2026-03-17 6/300 2026-03-18 09:04 by 无际的草原
[考研] 311求调剂 +10 冬十三 2026-03-15 11/550 2026-03-18 09:04 by zhukairuo
[考研] 材料与化工求调剂 +6 为学666 2026-03-16 6/300 2026-03-17 20:15 by peike
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 机械专硕调剂 +3 笨笨兔子 2026-03-12 3/150 2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工求调剂一志愿 985 总分 295 +8 dream…… 2026-03-12 8/400 2026-03-13 22:17 by 星空星月
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
[考研] 土木第一志愿276求调剂,科研和技能十分丰富,求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生,2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
信息提示
请填处理意见