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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】在sybyl里如何批量加氢? 已有4人参与

有一百多个未加氢分子,现倒入到SYBYL里,全部没有加氢,请问有没有方法或是命令可以批量加氢呢?

    请懂得的人不吝赐教~~
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by piscesee at 2010-05-02 19:47:19:
把这些分子先放到一个database里
在sybyl里以Update的方式打开这个数据库
再在终端里输入
for mol in %database(*)
database get "$mol" M1
fillvalence M1 H
database add "M1" repla ...

刚试过以上命令,get "$mol" M1不能识别,is invalid or ambiguious.偶以前通常用的都是图形界面,在这方面没有什么常识,能否详讲下~~
6楼2010-05-04 10:15:18
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查看全部 11 个回答

piscesee

铁杆木虫 (正式写手)

应该可以,我试试啊
2楼2010-04-30 19:40:38
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-01 08:44
自己录个宏就可以啊,也就是所谓的 spl 脚本?
3楼2010-04-30 21:17:57
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-02 18:31
用SPL语言编写,然后用命令行读取,即可,具体操作看SYBYL手册。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2010-05-01 23:08:16
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