应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】在sybyl里如何批量加氢？
51/1返回列表
查看: 1731  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】在sybyl里如何批量加氢？ 已有4人参与

有一百多个未加氢分子，现倒入到SYBYL里，全部没有加氢，请问有没有方法或是命令可以批量加氢呢？

    请懂得的人不吝赐教~~
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Sybyl 常见问题及使用教程

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-04-30 11:56:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

绿茶QJM

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by piscesee at 2010-05-02 19:47:19:
把这些分子先放到一个database里
在sybyl里以Update的方式打开这个数据库
再在终端里输入
for mol in %database(*)
database get "$mol" M1
fillvalence M1 H
database add "M1" repla ...

刚试过以上命令，get "$mol" M1不能识别，is invalid or ambiguious.偶以前通常用的都是图形界面，在这方面没有什么常识，能否详讲下~~
赞一下 回复此楼
6楼2010-05-04 10:15:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

piscesee

铁杆木虫 (正式写手)
应该可以，我试试啊
赞一下 回复此楼
2楼2010-04-30 19:40:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-01 08:44
自己录个宏就可以啊，也就是所谓的 spl 脚本？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-04-30 21:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-02 18:31
用SPL语言编写，然后用命令行读取，即可，具体操作看SYBYL手册。
赞一下(1人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
4楼2010-05-01 23:08:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +4 翩翩一书生 2026-04-09 4/200 2026-04-10 00:07 by lwk2004
[考研] 22408调剂求助 +3 毂12 2026-04-09 5/250 2026-04-09 23:21 by zhouyuwinner
[考研] 计算机11408，286分求调剂 +9 木子念晞 2026-04-05 9/450 2026-04-09 20:04 by vgtyfty
[考研] 电子信息270求调剂 +11 terminal469 2026-04-07 11/550 2026-04-09 18:28 by hy861222
[考研] 一志愿郑州大学 22408 305分求调剂 +3 安小满zzz 2026-04-08 3/150 2026-04-09 16:16 by wp06
[考研] 283电子信息求调剂 +4 三石WL 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:21 by wp06
[考研] 一志愿985初试354分生物调剂 +3 031001 2026-04-06 3/150 2026-04-09 00:30 by Evan_Liu
[考研] 环境专硕调剂 +15 会说话的肘子 2026-04-06 15/750 2026-04-08 18:56 by 环化材-小生
[考研] 277求调剂 数一104分 +9 瓶子PZ 2026-04-05 14/700 2026-04-07 17:52 by 蓝云思雨
[考研] 080500求调剂 +12 黄宇博 2026-04-06 12/600 2026-04-07 12:41 by upczlm1989
[考研] 材料调剂 +17 小刘同学吖吖 2026-04-06 18/900 2026-04-07 11:41 by 诗与自由
[考研] 085405软件工程301分求调剂，专硕可跨专业，四六级已过 +3 静静想想 2026-04-05 3/150 2026-04-06 15:23 by nepu_uu
[考研] 一志愿河北工业大学材料工程，初试344求专硕调剂 +6 15933906766 2026-04-05 6/300 2026-04-06 13:21 by 无际的草原
[考研] 生物与医药调剂 +4 十七sa 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:05 by lys0704
[考研] 288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工 +13 洛神哥哥 2026-04-03 13/650 2026-04-05 17:27 by zzx2138
[考研] 一志愿北京化工大学，初试成绩350求调剂 +9 沿岸?贝壳 2026-04-04 14/700 2026-04-05 01:09 by 沿岸?贝壳
[考研] 338求调剂 +7 晟功? 2026-04-03 7/350 2026-04-04 20:37 by 蓝云思雨
[考研] 怎么删帖子啊 +3 缝曦1000 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:20 by 土木硕士招生
[考研] 320调剂 +4 农业工程与信息� 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:40 by lbsjt
[考研] 315求调剂 +6 顺理成张 2026-04-03 8/400 2026-04-03 14:04 by 百灵童888
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭