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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】在sybyl里如何批量加氢?已有4人参与

有一百多个未加氢分子,现倒入到SYBYL里,全部没有加氢,请问有没有方法或是命令可以批量加氢呢?

    请懂得的人不吝赐教~~
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by piscesee at 2010-05-02 19:47:19:
把这些分子先放到一个database里
在sybyl里以Update的方式打开这个数据库
再在终端里输入
for mol in %database(*)
database get "$mol" M1
fillvalence M1 H
database add "M1" repla ...

刚试过以上命令,get "$mol" M1不能识别,is invalid or ambiguious.偶以前通常用的都是图形界面,在这方面没有什么常识,能否详讲下~~
6楼2010-05-04 10:15:18
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
雪狼乖乖(金币+2):你的判断应该有道理的 空格也是字符变量 2010-05-04 22:14:07
雪狼乖乖(金币+1):关键是要给计算机开辟批量加氢的存储空间 一般无法执行的原因都因为格式或调用不对 2010-05-04 22:20:32
引用回帖:
Originally posted by piscesee at 2010-05-04 12:01:51:

我试了下可以呢,没什么问题啊

我试了下还是有问题类,内容是一样,就是空格不知道有没有影响

是不是要把*换成数据库名呢?
8楼2010-05-04 21:19:42
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by piscesee at 2010-05-04 23:20:07:

是不是没有打开数据库啊,先要打开一个数据库才行...

太感谢了,可以了,主要是命令空格出了问题,呵呵,谢谢,多次解答我的疑惑
10楼2010-05-05 10:11:47
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