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阳光金鱼唐

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】假阳性是什么原因造成的? 已有7人参与

蓝白斑筛选,长出了蓝斑和白斑,我挑白斑扩大培养,然后以菌液为模板,用目的片段的引物做PCR,却得不到我要的目的片段,是目的片段与载体没连接上吗?还是没转化成功?是假阳性吗?因为检测不出来,我目前也没法送去测序,急!!!还有,我后来重复做了多次,都长不出任何东西了,是不是载体放过期了,还是T4连接酶失效了?试剂盒从买回来到现在超过半年了,第一次动用是在4个月前,中间又用过几次。哪位大虾能够答疑,在下将感激涕零!
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fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1): 2010-04-29 15:29
应该是没有连上吧,假阳性原因很多:可能是X-gal 和IPTG没有涂开,也有可能染菌等
载体放-20°放个一年应该没有问题,至于连接酶失效有这种可能,你可以换一下吧
T载体连接是挺容易的  再做一次吧
几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
2楼2010-04-29 14:00:08
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+2):热心虫友~~ 2010-04-29 15:29
第一个问题,你挑的白斑是含有插入片段载体的菌,这是毋庸置疑的,因为如果载体自连,那么就是蓝斑,如果没有载体,菌就没有抗性,无法生长,所以一定是含有插入片段载体的菌,但是这个插入片段不一定是目的片段,造成这种现象的原因很多,PCR产物不纯,连接上引物片段,或者存在质粒污染等,针对这种现象,一般就是多挑白斑,筛选到阳性克隆。

第二个问题,我认为你的载体半年肯定不会有问题,而且之前你成功的获得了阳性克隆,现在建议你做一下试剂盒提供的对照,如果没有问题,就说明的目的片段的浓度和载体的配比或者是目的片段太长,连接失败造成的。
但就目前的情况看,你连蓝斑都看不见了,估计你做对照也不一定能行,所以很有可能是你的培养基或者抗性之类的出问题了,好好检查一下
3楼2010-04-29 15:02:53
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shengwufenzi

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我觉得是你的抗生素的问题
4楼2010-04-29 15:54:44
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gaiyf

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+2):感谢交流~~ 2010-04-29 16:26
第一个问题解决如下:你可以在菌斑长出来之后,放在4度至少4小时,这样一些本来是白斑的假阳性就会变成蓝斑。
第二个问题:可能的情况很多,首先怀疑试剂盒出问题是对的。因为反复冻融会使试剂盒失效。另外感受态也是很重要的一个环节,感受态制备不好,所以就不会长任何东西。
多看文献,多学知识
5楼2010-04-29 16:22:17
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liyong1981

金虫 (正式写手)


原因好多,抗生素啊,杂菌啊,或者IPTG除了问题,只能一样样排查了~
6楼2010-04-29 16:51:14
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peipeiliu

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
有可能是你的连接酶失效了
7楼2010-05-07 01:15:25
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zhang3shan

金虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也是,蓝白斑筛选,长出了蓝斑和白斑,我挑白斑扩大培养,然后以菌液为模板,用目的片段的引物做PCR,未得到目的片段,X-Gal和IPTG先加在培养基里,后倒平板,不知道问题出在哪,不知道你找到原因没,能不能帮我分析下,谢谢亲
star
8楼2014-01-14 21:35:13
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