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xppcomeon

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[交流] 【求助】如何利用DS获得已知配基ligand的SD files文件？已有4人参与

如何利用DS获得已知配基ligand的SD files文件？想利用此SD files文件获得受体的活性口袋

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1楼 2009-12-07 20:55:09

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tingjun

木虫 (小有名气)

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dock

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 12-16 14:43

不用知道配体的文件也行，你可以选中配体，然后以此来直接定义受体的活性口袋，定义好后，就可以删掉配体做对接了。如果你想得到配体的sd文件，可以在DS中选中配体然后只显示配体，将其另存为sd文件，即可，随后在定义活性位点是可以直接将配体拖入去掉配体的蛋白3D窗口，配体会自动找到口袋位置，其坐标还和原来在蛋白质复合物中的一样

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