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kele1982金虫 (正式写手)
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【求助】QSAR模型中交叉验证系数（q2）怎么获得？ 已有2人参与
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| 请问我用逐步回归分析方法得到一个QSAR模型，但是结果里面没有交叉验证系数q2（英文叫: leave-one-out），请问怎么计算得到啊？谢谢 |
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yalefield
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3楼2009-02-11 10:14:07
yalefield
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xuefei06(金币+5,VIP+0):thanks！ 2-11 22:47
kele1982(金币+2,VIP+0):谢谢！ 2-15 10:30
xuefei06(金币+5,VIP+0):thanks！ 2-11 22:47
kele1982(金币+2,VIP+0):谢谢！ 2-15 10:30
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（1）训练集与测试集的划分，本质上是一个实验设计问题。目前没有最好的，但D-optimal是一种选择。 （2）q2也好，R2也好，本质上其计算来自一组样本的观测值（或回归值）、平均值。 很明显，样本不同，这两个值肯定会变。 仅就含N个样本的训练集来说，采用LOO，即每次选9个样本（留下一个样本），那么就应该产生N个模型，也就有N个q2。 再看含有M个样本的测试集。 （1）如果只选择一个模型来预测，那么每个测试集样本都得到一个预测值。 进一步，可以用这些预测值（与观测值、平均值一起），计算R2. 可是，如果少选测试集中的一个样本，那么计算出来的R2是不是就变了？ （2）如果用前面的N个模型来预测，每个样本就会得到N个预测值。 嘻嘻，那么..... |
5楼2009-02-11 22:25:21
yalefield
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7楼2009-02-12 14:35:14
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9楼2009-02-12 18:58:57
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抱歉抱歉，是俺老糊涂了。
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xuefei06(金币+4,VIP+0):thanks！ 2-13 21:14
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俺把留一法和留多法搞混淆了，因此造成误解。作揖。 你的q2计算法是正确的。 俺本来的意思，是想说除了留一法，还有留多法。 为啥只留一个？留俩、仨，行不行？ 于是，就引申出多种交叉验证方法。 下面是百度百科上介绍的“十折交叉验证”。 ------------------------------------ 英文名叫做10-fold cross-validation，用来测试算法准确性。是常用的测试方法。 将数据集分成十分，轮流将其中9份作为训练数据，1份作为测试数据，进行试验。每次试验都会得出相应的正确率（或差错率）。10次的结果的正确率（或差错率）的平均值作为对算法精度的估计，一般还需要进行多次10折交叉验证（例如10次10折交叉验证），再求其均值，作为对算法准确性的估计。 之所以选择将数据集分为10份，是因为通过利用大量数据集、使用不同学习技术进行的大量试验，表明10折是获得最好误差估计的恰当选择，而且也有一些理论根据可以证明这一点。但这并非最终诊断，争议仍然存在。而且似乎5折或者20折与10折所得出的结果也相差无几。 ------------------------------------ 其中，多次10折交叉验证之说，对于留一法来说，就没有必要了。 最近有论文指出，交叉验证和Bootstrape方法不适合QSAR这种小样本的建模。 待俺走上前去，杀它个......PDF回来。 下面是Carnegie Mellon University的Andrew W. Moore教授关于交叉验证的PPT. |
11楼2009-02-12 21:37:53
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