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16s rRNA基因的V3区，VI-V3区，V3-V4区，测序区别？已有4人参与
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| 微生物高通量测序时，有时扩增16s rRNA基因的V3区，VI-V3区，V3-V4区，这三种类型是什么区别？ |
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7楼2016-10-25 19:19:13
2楼2016-10-23 23:26:57
3楼2016-10-24 09:52:10
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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用这3个都可以检测出细菌微生物。 在高通量测序时，对于测序区域的选择，通常需考虑以下几点： 1 测序长度。现在大多都用Illumina来测，正反双端测序，不同仪器，能测的长度不一样。如果测序的区域较长，超出了测序仪的范围，那么在测时只能测一段，而在生物信息分析时拼不完整，对于后续分析有较大问题。 2 测序质量。序列长度越长，后面的测序质量会越差，测的质量差的序列，在分析时会删除。在测序时，尽可能选择测出的较多的质量好的区域。 3 数据库。我们测完后是需要将序列放到数据库中进行比对的。所用的区域在数据库中的信息越多越好。 具体的你可以看一下我们公司录制的视频，下面是地址  http://www.tinygene.com/technical-support/video-data |
4楼2016-10-25 10:20:38