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meimmen

新虫 (初入文坛)

[交流] 16S rRNA宏基因组测序策略讨论

大家都知道单克隆可以用RNA引物扩增rRNA,然后用挑克隆做3730测序,如果是项目做16s rRNA宏基因组测序,大家会用什么测序策略:
1、RNA引物扩增成cDNA,打断到300bp左右(或者用区域引物扩增目的区域)然后加上测序接头,上MiseqPE300
2、RNA转录前打断成300nt左右,反转录成cDNA,加上pcr-free接头,上 Miseq
我是想到这两种比较合适,大家有什么建议?
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