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16s rRNA测序图不会看ＯＴＺ已有1人参与
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各位大神～我是今年刚跳入火坑的研一新生一枚····· 导师让我分离鉴定某种菌 我从鱼的组织里分离出了一株菌·····然后提取了细菌的全基因组，接着送去了测序···· 测序公司给我返回了测序的结果·· 请问接下来我要怎样才能知道这菌是属于哪个属啊？ |
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已经有6人回复- 对细菌进行测序时，测的是16S rDNA还是16S rRNA
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jingrong978
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【答案】应助回帖
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dllchina: 金币+1, 鼓励交流 2015-01-06 22:14:07
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kero酱: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2015-01-08 10:17:54
| 您好，我说的只供您参考一下。我做的是常规测序，是双脱氧末端终止法测定，您可以先用chromas软件打开测序峰图，因为返回到结果前面50bp左右不准确，后面的就有差异了，我一般是后面的660或是700之后的都会去掉。之后全部换成fasta格式保存成txt文本，然后跟ncbi上进行blast或是上传到RDP数据库，或是上传到EzBioCloud进行比对，这样就知道了。这是我做的。但是我不知道你的可不可以用这种方法，所以您可以先看一下。 |
2楼2015-01-06 15:20:37
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jingrong978
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DoRbIr
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6楼2015-01-09 14:32:17