24小时热门版块排行榜    

查看: 1589  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

kero酱

铜虫 (初入文坛)

[求助] 16s rRNA测序图不会看OTZ 已有1人参与

各位大神~我是今年刚跳入火坑的研一新生一枚·····
导师让我分离鉴定某种菌
我从鱼的组织里分离出了一株菌·····然后提取了细菌的全基因组,接着送去了测序····
测序公司给我返回了测序的结果··
请问接下来我要怎样才能知道这菌是属于哪个属啊?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kero酱

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jingrong978 at 2015-01-06 15:20:37
您好,我说的只供您参考一下。我做的是常规测序,是双脱氧末端终止法测定,您可以先用chromas软件打开测序峰图,因为返回到结果前面50bp左右不准确,后面的就有差异了,我一般是后面的660或是700之后的都会去掉。之 ...

非常感谢!
3楼2015-01-08 10:16:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

jingrong978

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
dllchina: 金币+1, 鼓励交流 2015-01-06 22:14:07
kero酱: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2015-01-08 10:17:54
您好,我说的只供您参考一下。我做的是常规测序,是双脱氧末端终止法测定,您可以先用chromas软件打开测序峰图,因为返回到结果前面50bp左右不准确,后面的就有差异了,我一般是后面的660或是700之后的都会去掉。之后全部换成fasta格式保存成txt文本,然后跟ncbi上进行blast或是上传到RDP数据库,或是上传到EzBioCloud进行比对,这样就知道了。这是我做的。但是我不知道你的可不可以用这种方法,所以您可以先看一下。
攻读海洋石油降解菌研究
2楼2015-01-06 15:20:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jingrong978

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by kero酱 at 2015-01-08 10:16:56
非常感谢!...

不客气,相辅相成。

[ 发自小木虫客户端 ]
攻读海洋石油降解菌研究
4楼2015-01-08 10:37:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DoRbIr

金虫 (正式写手)

16S怎么是全基因组送去测序啊,应该用16S引物扩增一下,连接到载体再测序啊
5楼2015-01-08 21:16:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:40 by 4wMiSEwB6436
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:28 by 4wMiSEwB6436
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] filecode +6 cratir 2026-08-14 10/500 2026-08-14 18:29 by 笑叹辞穷
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +6 majunge000 2026-08-11 8/400 2026-08-14 14:44 by 医学老男孩
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
请填处理意见