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Vasp中出了点问题:INCAR参数设置以后运行不了 已有2人参与
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其中INCAR各参数如下 NWRITE = 2 GGA = PE IBRION = 1 POTIM = 0.5 NSW = 300 EDIFFG = -5E-02 ISIF = 2 ISPIN = 1 NELM = 100 EDIFF = 1E-4 ENCUT = 415.00 eV # energy cut-off for the calculation LREAL = Auto # real space projection ISMEAR = 1 # set partial occ. for each orbital LWAVE = F ! write WAVECAR LCHARG = F ! write CHGCAR SYMPREC = 0.001 体系是个Pt大簇,共459个原子,给出POSCAR标题如下 CIF file 1.0 30.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 30.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 30.0000000000 459 selective dynamics Direct 运行以后检查cat *out就出现如下问题 demo@i4p0:~/rpren/zls/pt/pt> cat pt.out running on 12 nodes distr: one band on 1 nodes, 12 groups vasp.4.6.28 25Jul05 complex POSCAR found : 1 types and 459 ions LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup WARNING: wrap around errors must be expected 2 total processes killed (some possibly by mpiexec during cleanup) 然后按照网上的参数设置了一下还是不行,想请教各位是不是INCAR里头的参数设置出问题了?如果有问题怎么改正?谢谢!! |
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2楼2016-07-20 21:28:21
朱全喜
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现在来看INCAR设置好像没什么问题了,建议你做如下测试:团簇形状不变,原子数目逐渐增加到459个。这样优良个好处,其一是能够测试出是否由MPI并行运算等计算环境导致的问题报错;其二还能给出计算结果随团簇尺寸大小的变化关系,这一部分也能放在论文结果讨论中充实数据结果的可靠性。 发自小木虫Android客户端 |
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10楼2016-07-23 23:41:04
xmzhang86
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3楼2016-07-21 08:02:56
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谢谢回复。先开始是连用两台8核的,然后在一台24核上试了一下,接着cat *out得到如下结果: running on 24 nodes distr: one band on 1 nodes, 24 groups vasp.4.6.28 25Jul05 complex POSCAR found : 1 types and 459 ions LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup WARNING: wrap around errors must be expected FFT: planning ... 8 reading WAVECAR WARNING: random wavefunctions but no delay for mixing, default for NELMDL 6 total processes killed (some possibly by mpiexec during cleanup) 还是运行不了,所以可能是INCAR里头参数设置出问题了,但是就找不到,还有什么方法没有 |
4楼2016-07-21 15:50:23
5楼2016-07-21 15:52:12
朱全喜
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按道理你这么大的团簇VASP第一原理计算已无力了,除非有成百上千个核可能还将就点儿。如果你的超算资源有限(核数无法再增加),那么你可以试着调一下电子迭代步的参数。因为从结果文件来看第一个离子步的loop都跑不起来,那肯定不应该是离子步的相关参数引起的。我仔细琢磨了一下,可能有效的参数也就剩ALGO或IALGO以及ENCUT。建议ENCUT=300即可,参考Pt的赝势文件ENMAX=230,以减少平面波展开数;其二是IALGO=48,增加迭代收敛的可靠性。当然以上仅是尝试,主要问题还是在你计算资源和计算任务的不匹配上,只能祝福以上建议能够对你有用了。 发自小木虫Android客户端 |
6楼2016-07-21 16:31:20
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感谢大神回复。我按你的参数重新设置了一下INCAR,如下 NWRITE = 2 GGA = PE IBRION = 1 POTIM = 0.5 NSW = 300 EDIFFG = -5E-02 ISIF = 2 ISPIN = 1 NELM = 100 EDIFF = 1E-4 ENCUT = 300 eV # energy cut-off for the calculation LREAL = Auto # real space projection ISMEAR = 1 # set partial occ. for each orbital LWAVE = .FALSE. LCHARG = .FALSE. ENMAX = 230 IALGO = 48 SYMPREC = 0.001 然后连用两台24核的,接着cat *out显示如下 running on 48 nodes distr: one band on 1 nodes, 48 groups vasp.4.6.28 25Jul05 complex POSCAR found : 1 types and 459 ions LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup WARNING: wrap around errors must be expected FFT: planning ... 4 reading WAVECAR WARNING: random wavefunctions but no delay for mixing, default for NELMDL 3 total processes killed (some possibly by mpiexec during cleanup) 还是运行不了,真不知道什么原因,求大神指导! |
7楼2016-07-22 09:46:42
朱全喜
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那再加个参数NELMDL=-5,试试看吧!按报错提示你这个版本的VASP应该默认的这个参数是0,也就是直接进行自洽迭代计算。而对于团簇计算,由于自洽迭代收敛有时非常糟糕,所以最好是先delay(延迟)几步,即先进行几步非自洽计算得到波函数和电子密度,然后以此为初猜进行后面的自洽迭代计算。设置NELMDL=-5,就是延迟3步 发自小木虫Android客户端 |
8楼2016-07-22 10:53:28
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大神你好!我的作业运行还是出了问题。这次是连用两台24核算的 INCAR如下: NWRITE = 2 GGA = PE IBRION = 1 POTIM = 0.5 NSW = 300 EDIFFG = -5E-02 ISIF = 2 ISPIN = 1 NELM = 100 EDIFF = 1E-4 ENCUT = 300 eV # energy cut-off for the calculation LREAL = Auto # real space projection ISMEAR = 1 # set partial occ. for each orbital LWAVE = .FALSE. LCHARG = .FALSE. ENMAX = 230 IALGO = 48 SYMPREC = 0.001 NELMDL=-5 然后cat *out如下: running on 48 nodes distr: one band on 1 nodes, 48 groups vasp.4.6.28 25Jul05 complex POSCAR found : 1 types and 459 ions LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup WARNING: wrap around errors must be expected FFT: planning ... 4 reading WAVECAR 2 total processes killed (some possibly by mpiexec during cleanup) 这次又是什么问题呢?期待回复 |
9楼2016-07-23 19:54:22











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