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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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lily_fj

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子模拟轨迹是什么 已有2人参与

第一次接触谁能说明一下分子模拟轨迹到底是什么呀,老师直接给的轨迹文件里面全是数字不明白。

@smutao 发自小木虫IOS客户端
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lily_fj(abinitio代发): 金币+5, 感谢应助,正解 2016-06-29 15:22:24
每一帧的所有原子的三维坐标
gromacs
2楼2016-06-27 10:43:22
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lily_fj

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fangsteel at 2016-06-27 10:43:22
每一帧的所有原子的三维坐标

那请问这个轨迹又是什么呢

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-06-27 20:58:53
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fangsteel

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lily_fj at 2016-06-27 20:58:53
那请问这个轨迹又是什么呢
...

坐标啊,所有原子的坐标变化构成的运动轨迹
gromacs
4楼2016-06-27 22:30:01
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MS_Z

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
就想连续的视频是由不同时刻的离散的图片组成的 轨迹文件里的数字就代表原子在不同时刻的位置

发自小木虫IOS客户端
5楼2016-06-28 18:56:08
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MS_Z

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lily_fj at 2016-06-27 20:58:53
那请问这个轨迹又是什么呢
...

这个轨迹代表的就是你模拟体系下的原子运动

发自小木虫IOS客户端
6楼2016-06-28 18:57:10
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lily_fj

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by fangsteel at 2016-06-27 22:30:01
坐标啊,所有原子的坐标变化构成的运动轨迹...

请问对轨迹想要看看每一帧的变化情况该怎么处理呢?
7楼2016-06-29 10:19:19
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