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026li金虫 (小有名气)
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扩散动力学模拟,total simulation time 等设置 已有3人参与
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在做多孔材料吸附小分子扩散时遇到设置问题: 1.total simulation time:一般设置多少?文献里200ps,1ps time step;为什么在分析里MDS曲线只能画出两个点?比如设置200ps,文献有说前100ps用来平衡的,后100ps不准,那总的时间设置多少比较合适。 2.系综选择,文献里有用NVE的,但是也有说先用NVT平衡,在用NVE计算的,这是为什么? 3.文献里有绘制出扩散路径的,MS里有这个功能吗?就是轨迹全部都记录下来的,从一个孔扩散到另一个孔的过程。historyfile save every xxsteps这个选项在哪里设置的? 吸附等温线的问题: 1.在MS里adsorption isotherm 里没有发现length simulation totally的设置,一般文献里写900万步,configuration of system was record every xxstep。first300万步用来平衡。这些都是如何找到的?MS里只有maximum loading steps;equilibration steps;production steps;return trajectory;return lowest energy frams选项。这些在模拟是代表什么?需要设置多少步合理? 2.sample interval 设置25,就是描绘了25个吸附点吗? |
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