[求助] 启动子作用元件分析已有3人参与

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1楼2016-06-26 13:35:31

kxmytmy

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2楼: Originally posted by 永远一片天 at 2016-06-26 17:47:49
我最近也在做这块，但是我用的方法是先找到基因序列，然后参考基因组方向，向前推2000bp，没有找到预测网站，所有的都只是大概的一个范围，没有准确的，除非文献中已有人报道过。

我是想预测一下启动子结合的顺式作用元件有哪些，启动子的克隆是一样的方法

3楼2016-06-26 19:34:45

kxmytmy

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4楼: Originally posted by 永远一片天 at 2016-06-27 10:14:01
如果你预测的话，可以去UCSC看看，很多都推荐用那个网站，但是具体怎么用，我没摸索明白，不过你可以去看看。...

哦，谢谢：）

5楼2016-06-27 14:27:24

kxmytmy

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6楼: Originally posted by stone2239 at 2016-06-28 12:43:13
可以用plantcare网站或place网站预测

place网站登录不上啊

7楼2016-06-28 19:07:43

kxmytmy

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9楼: Originally posted by 如是说 at 2016-06-29 23:45:51
你是想预测转录因子可能的结合位点吗？

想预测可能的结合元件，

11楼2016-06-30 18:56:38

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10楼: Originally posted by csfsophia at 2016-06-30 16:59:56
搜一下genomatrix，用matinspector软件分析

哦，我试试，谢谢：）

12楼2016-06-30 18:57:03

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13楼: Originally posted by 如是说 at 2016-06-30 21:44:29
Matinspector得用学校邮箱注册，大概有一个月的试用期，不怎么方便。
最近新发现一个，http://jaspar.genereg.net/
你可以试试，操作起来比较方便。
先在quick rseach中输入你的转录因子，点击进入。打勾
在右 ...

非常感谢

14楼2016-06-30 22:29:39