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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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kxmytmy

银虫 (正式写手)


[求助] 启动子作用元件分析 已有3人参与

各位大神,求助,启动子结合元件分析的网站有哪些可以用啊?
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永远一片天

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-06-30 07:34:37
xn8008: 应助指数+1 2016-06-30 21:46:22
我最近也在做这块,但是我用的方法是先找到基因序列,然后参考基因组方向,向前推2000bp,没有找到预测网站,所有的都只是大概的一个范围,没有准确的,除非文献中已有人报道过。
2楼2016-06-26 17:47:49
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普通回帖

kxmytmy

银虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by 永远一片天 at 2016-06-26 17:47:49
我最近也在做这块,但是我用的方法是先找到基因序列,然后参考基因组方向,向前推2000bp,没有找到预测网站,所有的都只是大概的一个范围,没有准确的,除非文献中已有人报道过。

我是想预测一下启动子结合的顺式作用元件有哪些,启动子的克隆是一样的方法
3楼2016-06-26 19:34:45
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永远一片天

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-06-30 07:35:02
引用回帖:
3楼: Originally posted by kxmytmy at 2016-06-26 19:34:45
我是想预测一下启动子结合的顺式作用元件有哪些,启动子的克隆是一样的方法...

如果你预测的话,可以去UCSC看看,很多都推荐用那个网站,但是具体怎么用,我没摸索明白,不过你可以去看看。
4楼2016-06-27 10:14:01
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kxmytmy

银虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by 永远一片天 at 2016-06-27 10:14:01
如果你预测的话,可以去UCSC看看,很多都推荐用那个网站,但是具体怎么用,我没摸索明白,不过你可以去看看。...

哦 ,谢谢:)
5楼2016-06-27 14:27:24
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以用plantcare网站或place网站预测

发自小木虫Android客户端
6楼2016-06-28 12:43:13
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kxmytmy

银虫 (正式写手)


引用回帖:
6楼: Originally posted by stone2239 at 2016-06-28 12:43:13
可以用plantcare网站或place网站预测

place网站登录不上啊
7楼2016-06-28 19:07:43
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by kxmytmy at 2016-06-28 19:07:43
place网站登录不上啊...

恩,就是,PLACE网站现在暂时用不了。
8楼2016-06-29 19:14:26
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如是说

木虫 (著名写手)

你是想预测转录因子可能的结合位点吗?

发自小木虫Android客户端
9楼2016-06-29 23:45:51
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csfsophia

新虫 (初入文坛)

搜一下genomatrix,用matinspector软件分析

发自小木虫IOS客户端
10楼2016-06-30 16:59:56
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