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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 关于autodock做分子对接
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mliwang

新虫 (初入文坛)
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关于autodock做分子对接
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首先是那个pdb文件，我在pdb数据库里面找到的，但是为什么我每次输入一个名字，它都给我一堆，我想知道如何找到自己想要的那个名字的靶点结构。


还有一个问题就是在做完对接后出来的结果，在autodock中它是按打分结果最高的位置排第一的吗？还有那个KI是什么值代表什么意思？

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1楼 2016-04-18 20:55:13
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pymol

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Ki是抑制力常数，越小越好。。。
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mliwang
19楼2016-04-19 18:26:31
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mliwang

新虫 (初入文坛)
来了的都帮我解答下吧

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17楼2016-04-18 20:56:22
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mliwang

新虫 (初入文坛)
不要光强红包呀，能不能帮我解答下问题

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18楼2016-04-18 20:57:20
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mliwang

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
19楼: Originally posted by pymol at 2016-04-19 18:26:31
Ki是抑制力常数，越小越好。。。

谢谢大神指点，我能再问几个问题吗？比如那个在pdb数据库找不到的靶点结构还可以去哪里找？还有做半柔性对接的话小分子中的柔性残基如何设置？有没有专门的数据库。。。问题有点多，希望您能帮我下
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20楼2016-05-01 19:27:05
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kisssme

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
KI为药物与受体的结合常数
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21楼2017-04-09 09:57:23
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andriyzhu2楼
2016-04-18 20:55   回复  
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diandubu3楼
2016-04-18 20:55   回复  
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雷神之锤1114楼
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skyish5楼
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Issue杨6楼
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烦夫俗子7楼
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水共公子丶8楼
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狂奔的蜘蛛9楼
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joy61672210楼
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zhenghe100811楼
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cuiyi12312楼
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禾田*棋子13楼
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阿廉14楼
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LM04169515楼
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w_shixiaoma16楼
2016-04-18 20:55   回复  
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