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【求助】lammps模拟碰撞竟然丢失原子，难道是势函数的问题？？ 已有2人参与
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 建了一个模型碰撞的时候一直丢失两个原子，都要疯了，为了检查错误，直接建立了一个简单盒子模拟碰撞，竟然还是报错丢失两个原子！请各路大神帮忙瞄瞄，很简单的小程序，咋会一直报错呢？请不要用什么截断半径过小，还是飞出盒子这样的话回复我。因为我觉得完全不可能飞出盒子，步长也调到过0.00001ps，但是不解决问题，而且是周期边界，丢失原子觉得很奇怪啊！ velocity 0 0 500的时候没问题，但是速度一提高就报错，比如velocity 0 0 1000。实在是不知道咋办了，所以请各路大神帮忙看看，小弟先谢过了。可能有些同学打开附件有问题，所以我直接把代码粘贴出来了，势能是lammps自带的势能 units metal boundary p p p atom_style atomic lattice bcc 2.855 #orient x 1 1 1 orient y -1 -1 2 orient z 1 -1 0 region box block -16 16 -15 15 -20 20 create_box 1 box mass 1 56.0 create_atoms 1 box pair_style eam/alloy pair_coeff * * Fe_mm.eam.fs Fe timestep 0.001 neighbor 1.5 bin neigh_modify every 30 delay 0 check no #displace_box all z delta -2 2 remap none compute pe all pe/atom compute dis all displace/atom dump 1 all custom 500 2.lammpstrj id type x y z vx vy vz c_pe c_dis[1] fix 3 all nvt temp 300 300 0.1 run 1000 unfix 3 write_restart dislocation.restart ——————————————————下面是restart文件 read_restart dislocation.restart lattice bcc 2.855 #orient x 1 1 1 orient y -1 -1 2 orient z 1 -1 0 pair_style eam/alloy pair_coeff * * Fe_mm.eam.fs Fe timestep 0.0001 neighbor 1.5 bin neigh_modify every 10 delay 0 check no compute pe all pe/atom compute dis all displace/atom dump 2 all custom 100 4.lammpstrj id type x y z vx vy vz c_pe c_dis[1] group kpa id 62410 velocity kpa set 0.0 0.0 1000.0 units box fix 5 all nve run 1000 unfix 5 |
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2016-04-01 10:16:49, 328.17 K
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3楼2016-04-01 13:15:09
hooge
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【答案】应助回帖
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大懒猫王浩: 金币+300, ★★★★★最佳答案, 师兄竟然来赚金币了，，，，不好意思，只能给师兄了。。。 2016-04-01 17:29:35
月只蓝: IP检查，初步认定为马甲行为，涉嫌转移金币，违反论坛相关管理规定：http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3711903 2016-04-02 10:16:56
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来来来，我来赚金币啦~ 在辐照损伤的模拟中，在离子间距离比较小时，已经不能用平衡态下的作用势来描述，一般用 ZBL 来描述这个碰撞过程。比如说常用到的 tersoff/zbl 作用势就势就是将 Tersoff 作用势与 ZBL 作用势通过一个费米函数连接起来，一般 认为小于 1Å 时需要用 ZBL 描述。 P.S. eam势木有官方的zbl衔接版本~ |
4楼2016-04-01 17:20:32
5楼2016-04-01 18:13:55
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