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分类	共搜索到 31 个相关话题(最多显示前5000个)	作者	最后发表

分子模拟	windows下DS2.5进行LibDock的时候出错出错信息为Failedtocreatehotspotfiles，请问可能造成的原因有那些	狙剑	2017-11-22 04:55
分子模拟	DS3.0里LigandFit问题安装了DS3.0，结果想做LigandFit的时候发现没有这个选项，按照说明书去找也没有找到，这个是怎么回事，是在那个interaction下面的DOCKLigands里吗？那里面只有libDock和CDOCK啊	caffey0387	2017-04-11 01:05
分子模拟	DSLibscore问题请教请问下大家，一般用Libdock进行小分子和蛋白的对接，打分函数能给出的分数大概有多少？...我是先用SYBYL先去水分子去配体，然后生成的某某_H文件在DS2.5里打开的，然后按照教程一步步做的。...	caffey0387	2017-04-06 05:04
分子模拟	基础操作求助在用DS做Libdock时，为什么别人打开的蛋白结构是图一那样的，我打开的却是图二那样的啊？这样会影响分子对接的结果吗？图一图二	li97358659	2017-03-20 03:05
分子模拟	季铵盐类药物小分子采用DS软件和蛋白进行分子对接？季铵盐类药物小分子采用DS软件和蛋白进行分子对接，其中季铵盐中的氮原子上...请问在用DS软件中libdock进行对接时，我的正电荷怎么处理？请各位虫子们帮我解答一下。谢谢。急求，在线急等。	littlehong	2016-09-23 02:39
分子模拟	DS在win8系统里运行Libdock一直在running step1，不进行下面一步... 如题	sweety01232	2016-06-16 10:20
分子模拟	使用DS对接配体错误使用discoverystudio的libdock模块对接，一直对接失败。开始提示配体类型错误，后来是inputlligands6;conformationsgenerated:89;ligandsfailedtodock:6;noligandsdocked请问是什么问题引起...	宸雨沐沐	2016-06-14 08:57
分子模拟	求大神帮忙分析下DS的对接结果，跪求小弟刚自学的Discoverystudio,用Libdock做的蛋白和多酚化合物的对接，用2D视图保存了结果，但不会分析，求各位大神不吝赐教，另...谢谢了小弟不理解各种颜色的残基代表什么，还有ds可以模拟出...	308866814	2015-10-13 02:36
分子模拟	DS-分子对接求助各位大虾：利用DiscoveryStudio中CDOCKER和LibDock做分子对接研究，如果采用默认参数，晶体复合物中配体分子对接回原蛋白后得不到较好的结果，一般会修改哪些参数呢？谢谢！	珍维永久	2015-09-14 07:38
分子模拟	做了libdock，还想进行做分子动力学模拟，求助我用Discoberystudio做了libdock之后有，最高分有209的，180以上有7个，这样意味着什么...所以在这里想请教各位大侠，DS跑完libdock之后要如何操作才能对最高分构象做动力学模拟呢。不胜感激啊	frong	2015-08-15 08:54
分子模拟	蛋白质相互作用本人正在用DS做蛋白质相互作用，应用蛋白质对接技术未成功；因此设想使用分子对接技术libdock和flexibledocking技术，设定其中一种大分子蛋白为受体，但配体蛋白的格式是.pdb如何变成.sd的...	落木778	2015-05-22 02:36
分子模拟	请问有人用DS做出氧化还原酶的分子对接吗配体是不是应该是中间体，就是羰基上一个氧带负电，碳带正电呀，用libdock和CDock对接了好几次都没成功，求大牛帮忙呀，到研三再来做对接伤不起呀	小绿~	2014-12-09 12:21
计算模拟	Inverse Docking by DS LibDock 小弟最近在研究反向对接的东西，想求一下创腾公司培训Discoverystudio中涉及到的“InverseDockingbyDSLibDock”的protocol。各位大神如果有其他的反向对接方法也请告知，重谢!	angelhunte	2014-09-15 07:52
分子模拟	DS运行后的文件保存路径怎么更改？请大师指点：我用DS里的libdock做了一个小分子对接，从DS里看，结果是保存到默认的C盘里，可是当我在C盘寻找的时候，却找不到相应的文件夹。	漂洋过海@	2014-06-09 02:51
分子模拟	关于DS中的Libdock 大家好，我使用DS4.0中的Libdock对接一个小分子酶抑制剂，运行完毕后显示0pose，noliganddocked，请问这是什么原因？请高手多多指点	moonoom	2014-05-05 12:50
分子模拟	12月4-6号沈阳药科大学Discovery Studio 培训班 00-10:15DiscoveryStudio基本界面DS背景...Libdock基本原理介绍及案例分析基本原理介绍及案例分析11:45-13:30午餐13:30-14:45基于受体药物设计之药物虚拟筛选-Libdock参数设置意义、实际操作...	zhangjizeng	2013-11-14 07:04
分子模拟	DS2.5问题求助使用DS2.5进行分子对接时，如何评价libdock，ligandfit以及CDOCKER对接结果的好坏？使用libdock进行分子对接时，如何在对接结果中看RMSD值？	张学升	2013-10-10 04:10
分子模拟	DS分子对接，总出现Ligands that failed conformer generation是... 新手求教：DS分子对接，ligand无论minimization与否，都出现Ligandsthatfailedconformergeneration，这是什么原因？ligand是一个小肽，是用buildandeditprotein工具化的另外，libdock的时候...	thanking1669	2013-09-11 02:27
分子模拟	DS分子对接总是出现0 pose 我的受体是同源模拟的出来的，配体是在ncbi上下载的，但是是2D的sdf格式，我用chem3D能打开，然后换了mol格式，并且用chem3D的MM2做了能量最低化，然后用DS的libdock做对接，对接位点就是选...	天湖酒	2013-09-09 07:07
分子模拟	DS LibDOCK 做完LibDOCK对接后，对于给出的分析结果中的以下参数不明白什么意思，求大神指教中文含义，本三学生跪谢1.PNG111.PNG	古小青	2013-04-15 12:49
分子模拟	DS LibDOCK LibDOCK是快速分子对接应该是属于刚性对接。为什么输入一个配体对接后会出现五种不同的POSE呢？对接前已做过配体的准备工作了。	古小青	2013-04-15 10:36
分子模拟	ds做完分子对接后如何寻找药效构象？一组化合物用ds做完libdock，生成了很多构象。要从里面挑出药效构象。这个要怎么弄？把蛋白质晶体结构里的配体分子拷进来，挨个的看构象和元晶体文件里配体的叠合效果么？还是有什么更科学...	molinsky	2012-11-02 07:21
分子模拟	请教高手关于蛋白质分子对接问题，先拜谢了 DS中在利用LibDock进行分子对接的时候，想要浏览对接poses时如何删除site文件和bindingsitesphere呀？刚接触DS，在照着教程学习，请高手不要见笑，劳烦高手指点！谢谢各位了！	yusuya	2012-09-13 12:20
分子模拟	ds在libdock时出错怎么办在ds中做libdock，点击运行后status出现error，detail显示的是allserverconnectionshavefailedorhavebeenterminated,我用的server是localhost：9943，Windows系统的，这是什么情况？...	鸡腿套餐	2012-04-23 02:45
分子模拟	DS3.1的tools中没有dock的libdock和cdocker 我安装了ＤＳ３.０，要做ＴＧＦｂｅｔａ与1ktz的对docking，但是我的tools下面怎么没有关于docking的工具呢？我安装DS后，文件有400多M，是不是差什么东西呀！求高手们指点，谢谢！下面是图	lb83074nx	2012-03-30 01:20