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caffey0387

木虫 (正式写手)

[交流] DSLibscore问题请教 已有2人参与

请问下大家,一般用Libdock进行小分子和蛋白的对接,打分函数能给出的分数大概有多少?我做了个对接,打分达到122分,这个是不是说明对接结果比较好?
另外,我的电脑做小点的蛋白还可以,做某些大的蛋白就死机,有时候会直接关闭程序,有时候会弹出对话框:bad allocation之类的,这个是我的机器太慢的原因吗?我是先用SYBYL先去水分子去配体,然后生成的某某_H文件在DS2.5里打开的,然后按照教程一步步做的。请各位老师指教!!!!
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caffey0387

木虫 (正式写手)

另外补充个问题:我想显示对接构象附近的氨基酸残基,包括名称,这个应该怎么操作呢,摸索了半天,不会。。。。。
2楼2017-04-06 13:37:36
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mddock

新虫 (小有名气)

3楼2017-04-06 20:52:54
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caffey0387

木虫 (正式写手)

我刚开始学习这个软件,很多都不会,还请不吝指教!!!
4楼2017-04-07 08:27:45
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慧1点点

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同学,我是西南大学的学生,最近也在研究libdock,想请教下你是怎么准备小分子配体的,谢谢?

发自小木虫IOS客户端
5楼2019-01-07 12:32:22
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