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利用高保真酶克隆基因没有加尾怎么办 已有5人参与
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刚开始做基因克隆,利用的高保真酶(takara Prime STAR),pcr完后直接切胶纯化后连接了,到最后发现效率特别低才听说要加尾,可现在的回收产物该如何利用呢? 目前,问了人总结出三种:一是以回收产物为模板,用rtaq酶加尾,但回收产物用量得14.5,做过一次可能跟产物浓度有关,成功率50%,二是以回收产物为模板,继续用STAR酶,用量几微升就可以,然后再用rtaq延伸,三是几微升的用量,直接用rtaq酶跑pcr。 我实在是拿不准该怎么办,求大神指点迷津!(产物浓度大部分6左右,4、5个30左右,还有一些只有2、3)如果可以,提供个参考体系最感激不过!●﹏● 发自小木虫Android客户端 |
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hanxiaominhu
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2楼2016-02-21 18:34:24
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PCR结束后,往反应体系中加入rtaq和buffer,72度充分延伸半个小时就行 发自小木虫Android客户端 |
3楼2016-02-21 19:42:16
kangaroo0513
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【答案】应助回帖
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1、你问人的3种答案,只有1比较靠谱,其他两种都别试,2和3那是增加突变概率。我试过PCR产物切胶回收后,再用普通的taq在buf和dNTP里72度30min,然后再回收,再连普通的T。这个办法看人品的,人品好的时候杠杠滴,人品差的时候就完蛋了。。并且两次回收,浓度会低。。。 2、由于后来我rp一直不好,就换了Thermo家的平末端连接试剂盒,发现虽然效率不太高,但是每次都有那么10来个菌,阳性率蛮高的。。也就是说,只要你不是建库,就可以用这个办法,省时省钱省力(由于自己也要用,我做了大量的平端载体,需要的话站短我吧!自连自杀型哦,只有连进去插入片段的才能活下来)。 3、使用无缝克隆试剂盒,直接把平端PCR产物克隆至目的载体上就完事。。这个最快,但是引物要重新设计。 如果是小白的话,推荐第二种,先从廉价简单的来尝试,这样经验值会up。。以后解决问题的能力也跟着up了,再逐渐慢慢玩高级货。。 加油!! |
5楼2016-02-22 00:42:55
匿名
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jackyoung
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二楼的平端克隆很靠谱,如果非要T-载体,可以直接拿回收产物加Taq和dNTPs 72度20分钟,不用回收直接连接。我们一般都是在PS酶括增体系的最后加入Taq,在72度孵育10分钟,然后切胶回收连接。 发自小木虫Android客户端 |

11楼2016-02-22 23:46:00
水杯小一
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VecScreen: Screen for Vector Contamination http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/vecscreen/ 还是去下载体再比对,这样容易看出问题。去载体如果没找到你的序列的话,实验要重新开始。如果是部分转入的话,还可以拿以前的菌再P一下,试试运气。 |
21楼2016-03-08 17:11:29
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