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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 荧光定量PCR与不同基因差异表达
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无语。。。

铜虫 (初入文坛)

[求助] 荧光定量PCR与不同基因差异表达 已有3人参与

请问一下同一样品中不同基因间的表达量怎么比较？用荧光定量得到了处理前和处理后内参和三个不同目的基因的Ct值，看一般文献里都是只分别看三个目的基因在处理前后的表达量变化，但怎么比较这三个基因之间的表达量高低？
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1楼 2016-01-07 15:28:12
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我是淡淡老师

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不同基因的表达量需要相互比较吗？
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2楼2016-01-07 18:57:06
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lifechuteng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
无语。。。: 金币+5, ★有帮助 2016-01-11 11:08:13
如果扩增效率为1且荧光值相同的完美情况下也是可以比较的，无非就是把一个样品中不同基因当作不同样本中的相同基因来比较，都与这个样品中的内参来做对比。
但麻烦的是，不同基因的扩增效率是不同的，且相同扩增效率下不同基因发出的荧光值也是不同的，所以实际情况下一般不能做比较。
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3楼2016-01-08 14:40:43
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无语。。。

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 我是淡淡老师 at 2016-01-07 18:57:06
不同基因的表达量需要相互比较吗？

相似度很高，编码几个同工酶，所以想看一下。

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4楼2016-01-09 23:23:26
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无语。。。

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lifechuteng at 2016-01-08 14:40:43
如果扩增效率为1且荧光值相同的完美情况下也是可以比较的，无非就是把一个样品中不同基因当作不同样本中的相同基因来比较，都与这个样品中的内参来做对比。
但麻烦的是，不同基因的扩增效率是不同的，且相同扩增效 ...

扩增效率在91%到98%之间，我感觉可以通过减去内参的ct来比较～不晓得准不准。

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5楼2016-01-09 23:27:15
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haze12344

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

可以试试用绝对定量的方法？
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生物你好
6楼2016-01-11 09:07:28
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大孙20111987

新虫 (小有名气)
你可以参考一下 Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative
PCR and the 2(-Delta Delta C(T)) Method. 对你的数据处理一下，我的RT-pcr结果都是这么做的
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做好自己，坚持到底
7楼2016-01-11 09:48:34
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andywang6137

木虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 大孙20111987 at 2016-01-11 09:48:34
你可以参考一下 Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative
PCR and the 2(-Delta Delta C(T)) Method. 对你的数据处理一下，我的RT-pcr结果都是这么做的

你好，你的意思同一组织中不同基因之间的qPCR结果可以进行比较吗？如果能，是如何比较的，谢谢!
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8楼2020-12-19 11:27:59
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andywang6137

木虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 大孙20111987 at 2016-01-11 09:48:34
你可以参考一下 Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative
PCR and the 2(-Delta Delta C(T)) Method. 对你的数据处理一下，我的RT-pcr结果都是这么做的

你好，你的意思同一组织中不同基因之间的qPCR结果可以进行比较吗？如果能，是如何比较的，谢谢!
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9楼2020-12-19 11:28:01
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