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feng0603新虫 (小有名气)
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lammps非周期性边界怎么实现压力控制 已有3人参与
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| lammps中周期性边界可以通过fix npt、fix press/berendsen、fix box/relax等命令实现（上述命令只针对周期性边界条件）。故对于非周期性边界控压问题怎么实现？请大神指点！谢谢！ |
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 分子动力学模拟 |
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【答案】应助回帖
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假定你的表面是固定的，可以参照这个帖子里的做法 http://lammps.sandia.gov/threads/msg29869.html 请仔细阅读这个帖子，我只是粗略看了一下。 你需要定义两个group,一个叫immobile，代表固定的表面；一个叫mobile，代表可以自由运动的原子。 根据这个帖子，主要是根据这两行语句实现的 fix Ffreezestuff immobile rigid single force * off off off torque * off off off 这句话相当于把表面固定住。 fix Fmovestuff mobile npt temp 300.0 300.0 100.0 z 10000.0 10000.0 1000.0 dilate mobile 这一部分就是控压 如果你的自由表面内所有原子是活动的，这个会相对简单一些 boundary p p f fix 1 all npt 300.0 300.0 100.0 aniso 0.5 0.5 1000.0 这里使用aniso选项对x,y,z方向分别进行控压。 |
feng06039楼2016-01-09 11:41:08
feng0603
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2楼2016-01-06 19:17:26
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【答案】应助回帖
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请仔细阅读lammps手册 http://lammps.sandia.gov/doc/fix_nh.html#fix-npt-command X, y, z cannot be barostatted if the associated dimension is not periodic. 当你的盒子在x,y,z三个方向上都是非周期性边界条件时，不能用fix npt，因为体积不可变，只能使用fix nvt |
3楼2016-01-07 12:02:46
bluewhale
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