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xiaorongwei金虫 (初入文坛)
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一个关于非周期性边界条件的问题
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一个关于非周期性边界条件的问题： 图中三条红色的线代表三个晶界，三个晶界面都和X轴平行，即三个晶界面都垂直纸面。 我现在在X轴方向采用周期性边界条件，在Z和Y方向采用非周期性边界条件。但是采用非周期性时，我采用NPT弛豫时，在运行（采用Lammps软件）的时候出现如下的错误 ERROR:Cannot use fix nvt/npt/nph on a non-periodic dimension。 下面是我的in文件的内容： units metal boundary p s s atom_style atomic read_data datanew mass 1 55.845 mass 2 63.546 mass 3 58.6934 timestep 0.01 thermo 3000 pair_style eam/alloy pair_coeff * * FeCuNi.eam.alloy Fe Cu Ni neighbor 2.0 bin neigh_modify every 1 delay 0 check yes thermo_style custom step etotal pe ke press temp vol lx ly lz min_style sd minimize 1.0e-12 1.0e-12 80000 80000 velocity all create 2.5 825577 dist gaussian compute 1 all pe/atom compute 2 all ke/atom compute coor all coord/atom 3.0 fix 1 all npt temp 2.5 2.5 1 iso 0.0 0.0 10.0 dump 101 all custom 3000 dump2.5-101.atom id xs ys zs c_1 c_2 c_coor dump 102 all custom 3000 dump2.5-102.lammpstrj id type x y z run 30000 为什么会出现这样的情况？？？fix 1 all npt temp 2.5 2.5 1 iso 0.0 0.0 10.0这行问题出在哪里？？？应该怎么改呢？？？ 谢谢...... |
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mengwuyu
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xiaorongwei: 回帖置顶 2011-12-09 08:10:41
| 你所用的系综npt应该在三个都是周期性边界的条件下啊，问题都说明白了ERROR:Cannot use fix nvt/npt/nph on a non-periodic dimension，你把boundary p s s改为boundary p p p |
2楼2011-10-24 21:32:19
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