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xiaorongwei

金虫 (初入文坛)

[求助] 一个关于非周期性边界条件的问题

一个关于非周期性边界条件的问题:

图中三条红色的线代表三个晶界,三个晶界面都和X轴平行,即三个晶界面都垂直纸面。
我现在在X轴方向采用周期性边界条件,在Z和Y方向采用非周期性边界条件。但是采用非周期性时,我采用NPT弛豫时,在运行(采用Lammps软件)的时候出现如下的错误
ERROR:Cannot use fix nvt/npt/nph on a non-periodic dimension。
下面是我的in文件的内容:
units   metal
boundary   p s s
atom_style   atomic
read_data  datanew
mass   1 55.845
mass   2 63.546
mass   3 58.6934
timestep   0.01
thermo   3000
pair_style   eam/alloy
pair_coeff   * * FeCuNi.eam.alloy Fe Cu Ni
neighbor   2.0 bin
neigh_modify   every 1 delay 0 check yes
thermo_style custom step etotal pe ke press temp vol lx ly lz
min_style sd
minimize 1.0e-12 1.0e-12 80000 80000
velocity    all create 2.5 825577 dist gaussian
compute   1 all pe/atom
compute   2 all ke/atom
compute   coor all coord/atom 3.0
fix   1 all npt temp 2.5 2.5 1 iso 0.0 0.0 10.0
dump   101 all custom 3000 dump2.5-101.atom id xs ys zs  c_1 c_2 c_coor
dump   102 all custom 3000 dump2.5-102.lammpstrj id type x y z
run   30000
为什么会出现这样的情况???fix   1 all npt temp 2.5 2.5 1 iso 0.0 0.0 10.0这行问题出在哪里???应该怎么改呢??? 谢谢......
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StevenMech

新虫 (小有名气)

NPT不需要全周期边界条件,只需要设制成周期方向控压即可。

发自小木虫Android客户端
5楼2019-09-04 21:39:09
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查看全部 6 个回答

mengwuyu

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
xiaorongwei(金币+1): 2011-10-25 07:54:40
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-10-25 10:21:19
xiaorongwei(金币+1): 2011-11-18 13:05:57
xiaorongwei: 回帖置顶 2011-12-09 08:10:41
你所用的系综npt应该在三个都是周期性边界的条件下啊,问题都说明白了ERROR:Cannot use fix nvt/npt/nph on a non-periodic dimension,你把boundary   p s s改为boundary p p p
坚持自己的方向勇往直前!
2楼2011-10-24 21:32:19
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Montton

新虫 (小有名气)

npt似乎必须全部是周期性条件的。不过我不明白你的这句话:“为了不引入第二界面,在Y和Z方向不采用周期性边界条件,所以不知道Y和Z方向的边界条件怎么处理???”为什么说全部是周期性的会引入第二界面?
3楼2012-11-28 19:45:41
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伊有涯

新虫 (小有名气)

楼主解决了吗?如何在非周期性边界条件下弛豫?
喜欢天空,百看不厌。当然不看也可以。
4楼2018-08-22 09:51:48
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