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feng0603

新虫 (小有名气)

[求助] lammps非周期性边界怎么实现压力控制 已有3人参与

lammps中周期性边界可以通过fix npt、fix press/berendsen、fix box/relax等命令实现(上述命令只针对周期性边界条件)。故对于非周期性边界控压问题怎么实现?请大神指点!谢谢!
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
feng0603: 金币+2 2016-01-08 19:25:48
请仔细阅读lammps手册
http://lammps.sandia.gov/doc/fix_nh.html#fix-npt-command

X, y, z cannot be barostatted if the associated dimension is not periodic.

当你的盒子在x,y,z三个方向上都是非周期性边界条件时,不能用fix npt,因为体积不可变,只能使用fix nvt
3楼2016-01-07 12:02:46
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普通回帖

feng0603

新虫 (小有名气)

自己顶一下!望大神指点!谢谢!
2楼2016-01-06 19:17:26
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bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
feng0603: 金币+2 2016-01-08 19:13:21
对于非周期性方向的调整,可能需要自己编写程序了。
4楼2016-01-07 19:13:45
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wolfshow

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
feng0603: 金币+2, ★★★很有帮助 2016-01-08 19:13:07
你的控压是指什么?
非周期性边界可以施加外力载荷
肥超fatcharm
5楼2016-01-08 15:36:37
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feng0603

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wolfshow at 2016-01-08 15:36:37
你的控压是指什么?
非周期性边界可以施加外力载荷

谢谢回复!比如材料生长、刻蚀都是在一定真空度下(0.5pa)进行的,我想在这样的压力环境下做模拟。因为本人刚做lammps不久,请大神指点!
6楼2016-01-08 19:12:30
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feng0603

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wolfshow at 2016-01-08 15:36:37
你的控压是指什么?
非周期性边界可以施加外力载荷

模拟中x、y方向是周期性的,Z方向是自由表面为非周期性边界。
7楼2016-01-08 19:21:31
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feng0603

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lsloneil at 2016-01-07 12:02:46
请仔细阅读lammps手册
http://lammps.sandia.gov/doc/fix_nh.html#fix-npt-command

X, y, z cannot be barostatted if the associated dimension is not periodic.

当你的盒子在x,y,z三个方向上都是非周期性 ...

谢谢回复!模拟中x、y方向为周期边界,z表面为自由表面,为周期性边界。自由表面暴露在0.5Pa的环境压力中,怎么实现在此压力环境中的模拟!?本人刚接触lammps不久,望大神指点!谢谢!
8楼2016-01-08 19:24:43
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by feng0603 at 2016-01-07 23:24:43
谢谢回复!模拟中x、y方向为周期边界,z表面为自由表面,为周期性边界。自由表面暴露在0.5Pa的环境压力中,怎么实现在此压力环境中的模拟!?本人刚接触lammps不久,望大神指点!谢谢!...

假定你的表面是固定的,可以参照这个帖子里的做法

http://lammps.sandia.gov/threads/msg29869.html

请仔细阅读这个帖子,我只是粗略看了一下。

你需要定义两个group,一个叫immobile,代表固定的表面;一个叫mobile,代表可以自由运动的原子。

根据这个帖子,主要是根据这两行语句实现的
fix Ffreezestuff immobile rigid single force * off off off torque * off off off
这句话相当于把表面固定住。
fix Fmovestuff mobile npt temp 300.0 300.0 100.0 z 10000.0 10000.0
1000.0 dilate mobile
这一部分就是控压

如果你的自由表面内所有原子是活动的,这个会相对简单一些
boundary  p p f
fix 1 all npt 300.0 300.0 100.0 aniso 0.5 0.5 1000.0
这里使用aniso选项对x,y,z方向分别进行控压。

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9楼2016-01-09 11:41:08
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feng0603

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by lsloneil at 2016-01-09 11:41:08
假定你的表面是固定的,可以参照这个帖子里的做法

http://lammps.sandia.gov/threads/msg29869.html

请仔细阅读这个帖子,我只是粗略看了一下。

你需要定义两个group,一个叫immobile,代表固定的表面;一 ...

好的!我按帖子里提示的试试!谢谢大神耐心指点!
10楼2016-01-09 12:58:47
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