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二月smile

新虫 (初入文坛)

[求助] 标曲溶解曲线单一峰,但梯度稀释后,Ct值基本无差别,线性很差,扩增效率高的吓人 已有1人参与

如图,不知道是怎么回事啊,理论上,不同梯度的浓度的质粒的Ct值是有差别的,可以分开的啊。我做的另一个基因是可以分开的,为什么这个的Ct值都在一起呢。我是按1ul+9ul稀释的。扩增条件是:94℃预变性4min,45个循环为94℃变性45s,61℃退火45s,72℃延1min,最后再在72℃延伸20min。体系是:引物10uM各 1ul,mix12.5,双蒸水10,模板1ul(10ng/ul).    新手求助!急!!急!!急!!

标曲溶解曲线单一峰,但梯度稀释后,Ct值基本无差别,线性很差,扩增效率高的吓人
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标曲溶解曲线单一峰,但梯度稀释后,Ct值基本无差别,线性很差,扩增效率高的吓人-1
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标曲溶解曲线单一峰,但梯度稀释后,Ct值基本无差别,线性很差,扩增效率高的吓人-2
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二月smile

新虫 (初入文坛)

是质粒没有稀释开吗?
2楼2015-11-05 15:26:52
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wjf7862203

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 二月smile at 2015-11-05 16:32:36
楼主,我还想问一个问题。我样品的平行间也不好,是有些基因本身就不好稀释混匀吗?还是其他原因。...

基因连到质粒,质粒作为阳性模板,一般都可以稀释开的,我一般一直稀释到10的1次方,还有质粒比较容易污染,稀释时要注意,

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9楼2015-11-05 19:16:05
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普通回帖

二月smile

新虫 (初入文坛)

在线等,急啊。导师快没耐心了,跟样品一起做了两次失败了,然后做标曲,又失败了。浪费了很多药品,还是没找到原因,不敢再试了。大神们,快快帮帮我。
3楼2015-11-05 15:32:42
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wjf7862203

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
二月smile: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-11-05 16:41:50
没有稀释好,标准曲线,稀释很关键,稀释好就是成功一半了。1ul+9ul稀释很不好稀释,量太少了,建议你加大稀释体积20ul+180ul。稀释时注意混匀,枪头用进口的吸的准一些,稀释液可以考虑用TE

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4楼2015-11-05 15:59:22
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二月smile

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wjf7862203 at 2015-11-05 15:59:22
没有稀释好,标准曲线,稀释很关键,稀释好就是成功一半了。1ul+9ul稀释很不好稀释,量太少了,建议你加大稀释体积20ul+180ul。稀释时注意混匀,枪头用进口的吸的准一些,稀释液可以考虑用TE
...

楼主,我还想问一个问题。我样品的平行间也不好,是有些基因本身就不好稀释混匀吗?还是其他原因。
5楼2015-11-05 16:32:36
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二月smile

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wjf7862203 at 2015-11-05 15:59:22
没有稀释好,标准曲线,稀释很关键,稀释好就是成功一半了。1ul+9ul稀释很不好稀释,量太少了,建议你加大稀释体积20ul+180ul。稀释时注意混匀,枪头用进口的吸的准一些,稀释液可以考虑用TE
...

我的质粒是10次方,有人建议我,1到1000稀释到7次方,然后100到1000逐级稀释6-3次方。这样可行吗?
6楼2015-11-05 16:36:19
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upgo123

金虫 (小有名气)

我们做标曲是将模板稀释若干个梯度:-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8;取-3、-4、-5、-6四个梯度,两个平行做标曲,结果还可以,高浓度模板的CT值在18左右。不过我们用的染料是SYBR GREEN,不知道FAM是否适用。
另外,看你的扩增CT值还不低,是不是模板浓度本身就高,要不你以100为梯度稀释试试看
选择,然后坚持
7楼2015-11-05 16:48:12
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许彦

木虫 (正式写手)

会不会存在强阳污染的问题,有没有阴性对照

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8楼2015-11-05 17:04:22
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wjf7862203

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 二月smile at 2015-11-05 16:36:19
我的质粒是10次方,有人建议我,1到1000稀释到7次方,然后100到1000逐级稀释6-3次方。这样可行吗?...

我一般在灵敏度的时候随便把标准曲线给做了,标准曲线一般取5个稀释度,10的2,3,4,5,6次方,

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10楼2015-11-05 19:20:31
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