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关于荧光定量PCR 标准曲线的问题
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LY1199
铁虫
(小有名气)
应助: 1
(幼儿园)
金币: 9.9
帖子: 89
在线: 23.8小时
虫号: 3895347
注册: 2015-05-25
性别: GG
专业: 微生物生态学
[
求助
]
关于荧光定量PCR 标准曲线的问题
已有1人参与
我用绝对定量的 qPCR 测定某个基因A在土壤样品中的copy数目
查了好多文献,大都是:采用还有这个A基因的单拷贝质粒DNA进行标准曲线的制备,将其稀释到一定倍数,
这里产生了疑问
1)为什么要构建含A基因的单拷贝质粒
2)直接利用A基因的PCR产物进行目的片段浓度确定,再转换成copies/ul等形式,不可以吗??为什么??
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1楼
2015-10-20 09:26:08
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刘阿杰T
新虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
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在线: 11.4小时
虫号: 7484835
注册: 2017-11-17
性别:
MM
专业: 果树学
请教一下,不太懂QPCR的做法,只能先提取RNA,再反转录为cDNA 再进行以后的步骤,还是可以直接用DNA也可以?
发自小木虫IOS客户端
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5楼
2017-11-22 10:25:32
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高gaoeryang
银虫
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应助: 18
(小学生)
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散金: 300
红花: 3
帖子: 116
在线: 262.5小时
虫号: 2042656
注册: 2012-10-04
性别:
MM
专业: 生物化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
LY1199: 金币+5,
★★★
很有帮助
2015-11-21 14:10:34
使用质粒有以下原因:
(1) 很多实验者都推荐之。
(2) 质粒比较纯。
(3) 质粒稳定。
(4) 质粒定量准确。
(5) 质粒制备方便,廉价,大量。
(6) 使用质粒来开始学习/试验real time PCR, 可以减少模板误差,就易于摸索其它条件的优化。
PCR产物也可以,但是:
(1) 短,线性→不稳定。
(2) 模板就是扩增子,末端就是引物结合部位,端点降解直接影响引物结
合。
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3楼
2015-10-23 16:48:04
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懒蛋
铁杆木虫
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在线: 356.5小时
虫号: 1231871
注册: 2011-03-13
性别: GG
专业: 环境微生物学
楼上完全正确。此外 pcr 产物做模版,扩增效率没有质粒高,有时可能卡在70%再上不去了。因为引物anneal到质粒上的概率要高于pcr 片段,因为pcr两端再无其他序列可target。
发自小木虫IOS客户端
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向钱看,向厚赚
4楼
2015-10-26 00:11:27
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