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王希lily

新虫 (初入文坛)

[交流] SDS-PAGE图跑成这样怎么办呢?

最近一直在做蛋白,但是跑SDS-PAGE图总是跑不好,按照刚开始认为是样品处理不好,就重新处理了几次样品,但是结果还是不理想,后来认为是配胶的液体等有问题,就全部按照书上重新配了,但是结果还是遮样,开始MARKER还能跑清楚,重新配了液后就连MARKER 条带都跑不见了。请有经验的亲们指点一下,谢谢了。

SDS-PAGE图跑成这样怎么办呢?
SDS-PAGE图
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恶魔的左眼

木虫 (正式写手)

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王希lily: 金币+2 2015-10-08 10:57:03
重组蛋白表达纯化目的蛋白质条带模糊的相应对策
电泳凝胶浓度选择不当。
低于10Kd的小分子蛋白质要用Tricine胶。
靠近前沿的电泳带分辨率不佳。根据分子量与凝胶孔径的关系,选择适当浓度的凝胶。
蛋白质样品水解。注意除去蛋白质样品的内源性的水解酶,不要反复冻融。
电泳时间过长或过短。溴酚蓝达到分离胶的底部即应该关闭电泳电源。
缓冲溶液、SDS都要新鲜配制。
避免加样过多,提高分辨率。小体积样品可给出窄带,加样体积根据样品浓度和凝胶厚度灵活掌握。一般上样体积为10-15uL(即2-10ug蛋白质)。
加热变性后的蛋白质样品要放置到室温即电泳,不要久放,因为蛋白质的二硫键在高温下可能是会断开,但是暴露于空气中温度降低会重新形成二硫键,而且可能在过久放置过程中蛋白质可能会再折叠,更不要扔到冰箱里保存。

摘自:http://www.detaibio.com/topics/sds-page-faq.html
早上一副睡不醒的样子,下午一副没睡醒的样子,晚上一副打了鸡血的样子!
10楼2015-10-08 10:29:28
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普通回帖

yangzeng1991

木虫 (小有名气)

2楼2015-10-07 18:40:31
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sdjnyxn123

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你的胶没有点样孔,是怎么点的样啊

还有都跑到底了是为了看marker吗?

换一管marker跑跑看?你其他的跑得都还可以吧
3楼2015-10-08 08:44:24
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hanfusu

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
两个胶跑的是同一份样品吗?如果你不控制对照的话怎么确定是样品的问题还是胶的问题?
4楼2015-10-08 08:55:59
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dorecnu

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
王希lily: 金币+1, 有道理 2015-10-08 10:16:09
第一张图不太好,第二张图尚可。
想要跑一张漂亮的SDS-PAGE图可以改进一下方面:
1. 上样前使用nano-drop或其他方法测定样品总蛋白量,使得每个孔上样量一致且在最佳蛋白量范围,图会好看很多
2. 根据目标蛋白大小选择合适浓度的SDS-PAGE凝胶,小蛋白用15%左右的凝胶,一般大小蛋白使用10-12%浓度凝胶
3. 制作凝胶时浓缩胶与分离胶比例要合适,如果是新手把握不准可以买预制胶
4. 电泳时使用小电压电泳,并使垂直电泳槽置于0-4度环境(可以使用冰盒,也可以至于4度冷柜)
5. 使用预染marker,电泳时可以实时观察marker电泳情况
6. 蛋白条带分辨率不高,可以尝试使用小孔梳子聚集蛋白,往往可以提高条带分辨率
5楼2015-10-08 09:10:07
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王希lily

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yangzeng1991 at 2015-10-07 18:40:31
太浓了

请问是浓缩胶还是分离胶太浓呢?

发自小木虫IOS客户端
6楼2015-10-08 10:08:34
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王希lily

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yangzeng1991 at 2015-10-07 18:40:31
太浓了

请问是浓缩胶还是分离胶太浓呢?如果想改进该如何做呢?
7楼2015-10-08 10:12:08
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王希lily

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sdjnyxn123 at 2015-10-08 08:44:24
你的胶没有点样孔,是怎么点的样啊

还有都跑到底了是为了看marker吗?

换一管marker跑跑看?你其他的跑得都还可以吧

亲,点样孔在跑完胶就切掉了,那是在浓缩胶的那部分。。。
8楼2015-10-08 10:12:58
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王希lily

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by dorecnu at 2015-10-08 09:10:07
第一张图不太好,第二张图尚可。
想要跑一张漂亮的SDS-PAGE图可以改进一下方面:
1. 上样前使用nano-drop或其他方法测定样品总蛋白量,使得每个孔上样量一致且在最佳蛋白量范围,图会好看很多
2. 根据目标蛋白大 ...

谢谢,我会试着改进一下。
9楼2015-10-08 10:14:59
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