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Michael4ever

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于ppiczαA转化毕赤酵母GS115后表型的鉴定 已有2人参与

各位大神,小弟接触毕赤酵母真核表达不久,很多东西不懂,大家都是怎么筛选mut+和muts的,ppiczαA和ppic9k不太一样,没有HIS4,一般不用md和mm筛选,我看文献里面用的是ypds培养基筛选的,我很好奇这样就能筛选出mut+么,还是得用pcr的方法鉴定表型?
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高gaoeryang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Michael4ever: 金币+20, 有帮助 2015-10-21 09:41:10
引用回帖:
6楼: Originally posted by Michael4ever at 2015-10-17 23:20:56
谢谢你,这么长时间终于有人回复了!但是据我所知,这种用抗性筛选出来的不是高拷贝么,跟表型有什么关系…
...

请仔细看酵母手册
Mut+和Muts:在毕赤酵母基因组中有2个醇氧化物酶编码基因,即AOX1基因和AOX2基因。菌株利用甲醇的速度主要是依靠AOX1基因表达的AOX1蛋白,其醇氧化物酶的活性非常高以至于在有AOX1 酶蛋白存在的情况下可以忽略AOX2酶蛋白,这就是甲醇营养型毕赤酵母的两种表型Mut+和Muts产生的原理。当菌株基因组中既有AOX1基因,也有AOX2基因时,菌株的表型为Mut+ 该菌株有甲醇的培养基中仍可以正常生长。当菌株基因组中仅有AOX2 因时,菌株的表型为Muts,该菌株在有甲醇的培养基中生长缓慢。

Mut+ or Muts跟你的酶切线性化方式和酵母菌株类型有关系,以GS115为例:sal1    his+mut+   
sac1   his+mut+
bgl2   his+muts
文献当中就这样用zeocin抗性筛选结合他的线性化方式,已经得出了理论上的结果。要是想严谨一些的话,就再做个鉴定。

然后对于你说的:“ppiczαA和ppic9k不太一样,没有HIS4,一般不用md和mm筛选”怎么就不能用md和mm进行筛选?鉴定酵母Mut+ or Muts最普通的方法就用到了这两个培养基,跟载体是什么没关系。
9楼2015-10-20 10:48:11
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-字仲康

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2楼2015-10-16 11:00:50
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-字仲康

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3楼2015-10-16 11:01:32
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-字仲康

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4楼2015-10-16 11:02:58
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高gaoeryang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

这个很简单,ppiczαA此载体上含有zeocin抗性,YPDS是指在YPD培养基中加入了zeocin抗生素。当你导入了ppiczαA载体,就赋予了原始菌株这种抗性,这样就可以筛出mut+了

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5楼2015-10-16 11:08:39
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Michael4ever

新虫 (初入文坛)

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引用回帖:
5楼: Originally posted by 高gaoeryang at 2015-10-16 11:08:39
这个很简单,ppiczαA此载体上含有zeocin抗性,YPDS是指在YPD培养基中加入了zeocin抗生素。当你导入了ppiczαA载体,就赋予了原始菌株这种抗性,这样就可以筛出mut+了

谢谢你,这么长时间终于有人回复了!但是据我所知,这种用抗性筛选出来的不是高拷贝么,跟表型有什么关系…

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6楼2015-10-17 23:20:56
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Michael4ever

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by -字仲康 at 2015-10-16 11:00:50
PPIC9K重组载体完成酵母转化时,平板恢复培养先用MD平板进行筛选,然后再用YPDS加G418抗生素进行筛选。
PPIC9K重组载体在线性化时,使用不同的酶会是有不同的表形的,你可以看看说明书

谢谢你,但是我用的不是ppic9k,是ppiczaA啊

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7楼2015-10-17 23:22:17
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Michael4ever

新虫 (初入文坛)

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4楼: Originally posted by -字仲康 at 2015-10-16 11:02:58
看到很很惨,之前我发帖求助也是,很多的奖励金币都没用,压根没有人进行回复解答的,有空多联系,我也在做酵母表达的

好滴好滴,有空多联系,实验室没有做这个方面的,问不到人,好憋屈的…

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8楼2015-10-17 23:23:58
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Michael4ever

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 高gaoeryang at 2015-10-20 10:48:11
请仔细看酵母手册
Mut+和Muts:在毕赤酵母基因组中有2个醇氧化物酶编码基因,即AOX1基因和AOX2基因。菌株利用甲醇的速度主要是依靠AOX1基因表达的AOX1蛋白,其醇氧化物酶的活性非常高以至于在有AOX1 酶蛋白存在的 ...

谢谢你,你的回答很详细,金币也给你了,但我还是想跟你深入探讨一下,我看的文献中只要是ppiczaA和组氨酸缺陷性菌株(GS115/KM71)配合使用的时候.无一例外都没有用MM和MD筛选过表型,这就引起了我的怀疑,再加上之前有个虫友也说过“组氨酸筛选只适合带有HIS4的表达载体同你的组氨酸缺陷性菌株配套的表达系统。你用的质粒ppiczaA没有HIS4,因此组氨酸筛选不合适,因此只能用抗性筛选。培养基就没必要用MM/MMH或者MD\MDH了,用YPDSZ培养基就可以了”这是不是说明在筛选表型的时候还是得根据你用的是什么质粒?MM和MD筛选我之前也做过,但是跟理论上分析的一样,由于没有组氨酸,菌株生长非常缓慢,而且营养不良,不饱满,根本无法筛选出手册上所说的“在两种培养基上均正常生长的为HIS+Mut+(因为根本没有HIS4基因嘛。。)”我用镜检排除了长的不是毕赤酵母的可能性。不知道在MD和MM的配置过程中加入组氨酸能否正常用于该情况的下的筛选?不过感觉还是YPDSZ筛选来的简单。。

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10楼2015-10-21 10:12:01
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