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饿的神啊

新虫 (著名写手)

[求助] 引物扩增效率太低,如何提高 已有5人参与

引物扩增效率低,只有64.4%,但是相关性较高,达到0.997,怎么提高引物的扩增效率呢

引物扩增效率太低,如何提高
溶解曲线.png


引物扩增效率太低,如何提高-1
扩增.png


引物扩增效率太低,如何提高-2
扩增效率.jpg
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
饿的神啊: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-09-13 16:14:54
引用回帖:
14楼: Originally posted by 饿的神啊 at 2015-09-12 19:26:04
引物是不是都是在保守区设计的?我试过别的引物,软件评价不好,得分很低,有发夹,错配什么的,好纠结
...

设计引物的标准可以写满一本书,但是检测只有一条,试一试才知道。这是一件后验的事情,而且各种标准的概率还不高,有点尽人事,听天命的感觉。不过你还是得把人事尽了。。。
16楼2015-09-13 13:52:13
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kobe199613

木虫之王 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
尝试提高dNTP浓度
在不影响扩增的条件下,适当降低退火温度,一般能解决。
当然稍微加大酶量也是起作用的。
【招聘】医用高分子材料研发工程师(北京)
5楼2015-09-11 21:28:20
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王冠傑

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
饿的神啊: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-09-13 16:10:56
首先排除引物质量问题,建议您做一个纯度测试,找合成公司都可以免费做。如果引物本身质量没有问题的话你换个位置重新设计引物吧,5端at所占比例要高一些,3末端最好是g或者c。

发自小木虫IOS客户端
7楼2015-09-12 06:47:23
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许彦

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by biostar2009 at 2015-09-11 19:56:56
跟多少倍稀释有关系么?...

我不太确定,我们一般都是十倍稀释的。

发自小木虫Android客户端
9楼2015-09-12 14:22:14
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普通回帖

许彦

木虫 (正式写手)

2楼2015-09-11 17:30:06
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by 许彦 at 2015-09-11 17:30:06
你确定是十倍稀释吗?

跟多少倍稀释有关系么?
3楼2015-09-11 19:56:56
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖


myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-09-11 20:14:31
R2很好,说明测得很准,
但是引物的扩增效率几乎是引物的固有属性,说明你只有换个地方再设计试试了。
尤其是偏低的,一般也跟抑制剂没啥关系。
4楼2015-09-11 19:58:58
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baichi121234

禁虫 (职业作家)

本帖内容被屏蔽

6楼2015-09-11 23:24:47
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棍子168

至尊木虫 (著名写手)

天道酬勤
8楼2015-09-12 08:01:00
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vincent_hpax

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是比较低 建议换引物,合成的时候选择高纯度合成

发自小木虫Android客户端
博学 慎思 明辨 笃行
10楼2015-09-12 14:59:52
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