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hclzfyt木虫 (正式写手)
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PCR产物切胶纯化后送出测序后,如何鉴定是不是我的目的片段。 已有1人参与
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如题,我用的方法是,用GENtle打开的返回的SEQ文件(不知道这样行不行啊)。 1、我的16 S PCR时使用的引物为 16s 27f AGRGTTTGATCMTGGCTCAG 16s 519r GTNTTACNGCGGCKGCTG 2、引物序列的说明 Sequence Code Deoxyadenine A Deoxycytosine C Deoxyguanidine G DeoxyThymidine T A+C+G V A+T+G D T+C+G B A+T+C H A+T W C+G S T+G K A+C M C+T Y A+G R A+G+C+T N 脱氧尿苷 U 次黄嘌呤 I 3、部分返回片段 B01 TGTATTACTGCGGCGGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTCCTTTGAAGGTACCGTCACTTCTCACGATTATTCACCGTGAAATCTTTCGTCCCTCCTGACAGTGGTTTACACCCCGAAGGGCTTCCTCCCACACGCGGCGTCGCTGGGTCAGCCTTTCGGCCATTGCCCAATATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGACCGTGTCTCAGTTCCAATGTGCGGGGTCGTCCTCTCAGACCCCGTAGCCGTCGCTGCCTTGGTGAGCCATTACCTCACCAACTAGCTGATAGCCCGCGAGCTCCTCCTGCCACCGTAGCATTGTAAAGAGGCCACGTTTCCCGAAAACCTCATCGAGGCTCTCGACCATGCGGTATTAGCGAAGGTCTCCCCTCGTTGTCCCCCGCAACAGGATAGATTGCTCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCACTCGCCTCAGTCCCGAAGGACTGGACTCGTTCGACTTGCATGTGTTAGGCACGCCGCCAGCGTTCGTCCTGAGCCAGGATCAAACCCTA C01 TGTATTACCGCGGCGGCTGAAATCAAGGATGCATGCGCGAAAGCGGTTGCGCATTGCAAAAGAATAAAGTGAGTATTGCCAAGCTGGCGCTGCAATTCGCCGTGGGCCATCGCGACATTGCCTCGACCCTGGTTGGATGCCCCACGCTGGGCCGAAGTAAAACAGAACGTGATTGTATTGAGCAGCCGATCGACATGGGTCTGGTGAGCGAGGTGTAGGAAATCCTGCGGCCAATCCAGAATCAAAACTGGCCGAGCGGCCTCACCGAAAACAATTAAGGGAAGCGCGGCTCGCCCCTCCCCTTCGCCTTTTCGATTTACAATTTGCGATTGGCGATTGGCGGAAGTAGGACGGGTCCAGTTCGGGGATCATGCCCCATTCAACCGGGCTTCCGCCTTCCCTTTGCCTCCCTTCCCTTCCCTTCTTTTCCCAACGCCGCGTTTGCACACCCCCCTCGCCTGAGCCAGGATCAAACCCT D01 TGTGTTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGACTTATTCCTCAGGTACCGTCATCATCGTCCCTGAGAAAAGAGGTTTACAACCCGAAGGCCTTCATCCCTCACGCGGCGTTGCTGCGTCAGACTTTCGTCCATTGCGCAAAATTCCCGACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTCTGGGTGATCGTCCTCTCAGACCACCTACCGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCCCACCAACGAGCTAATCGGACGCAGGCCCCTCCCGAAGCGCCTCACGGCTTTGATGGAACGAACGAACGTCCACCACATGCGGTATTAGCCACCCTTTCGGGCAGTTATTCCCCACTTCGGGGCAGGTCACCTACGCGTTACTCAGCCGTCCGCCACTAGCGACTCGAGCAAGCCCGAGTCACTCGTTCGACTTGCATGTCTCATGCACGCCGCCAGCGTTTATCCTGAGCCAGGATCAAACCCTA 我如何看有没有我要的目的片段,求各位高手指点,或是有没有别的更好的办法,纯新手大家勿喷,在此先谢过大家了。 |
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