24小时热门版块排行榜    

查看: 2718  |  回复: 8

爱起点

新虫 (初入文坛)

[交流] PCR产物大小比引物距离大很多,什么原因

如图,最左边是DL500maker,最上面是500pb,间隔100bp吗,maker右边三个是三个引物P出来以后的结果,第一条不太明显,大概450bp左右,第二个有两条带,第三个大概400bp左右,现在的问题是,我用的NCBI在线设计的引物,三个引物的产物大小应该是145bp,138bp,172bp,现在pcr产物的大小明显大很多,这是什么原因,请各位大侠多多指教。

PCR产物大小比引物距离大很多,什么原因
1.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

铁拳虎

至尊木虫 (知名作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
祝楼主万事顺意,心想事成,羊年发大财!!!
2楼2015-08-23 20:29:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我是鱼豆腐

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-08-23 22:54:22
首先,是marker不是maker...
你的marker跑出来的也不是很亮啊,你先改进一下你的电泳条件,该洗的都先洗干净换一换,然后才能判断是引物还是模板问题
3楼2015-08-23 21:21:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

爱起点

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 我是鱼豆腐 at 2015-08-23 21:21:31
首先,是marker不是maker...
你的marker跑出来的也不是很亮啊,你先改进一下你的电泳条件,该洗的都先洗干净换一换,然后才能判断是引物还是模板问题

不是电泳的问题,谢谢。
4楼2015-08-24 09:01:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanyu426980

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引物特异性不高,最好blast一下你的引物和你的模板序列
5楼2015-08-24 11:15:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小猪猪123456

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-08-27 22:59:04
爱起点: 金币+1, 谢谢 2015-08-29 21:19:34
可能是你引物设计不太正确,方便给一下序列么? 导致扩出来的PCR产物不是你想要扩增的目的基因。至于中间第二泳道出现了两条带,只能说明,你的产物不纯。第一条带没有说明你要么点样出了问题,要么是你的PCR引物不正确,导致不能扩增出产物。第三条带不那么清晰,可能是聚合酶加少了或者是聚合酶活性较低,或者是dNTP的量过少等等。终其原因,最好先重新设计一下引物,然后一步步重新认真做!祝君成功!
6楼2015-08-27 21:15:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

爱起点

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 小猪猪123456 at 2015-08-27 21:15:14
可能是你引物设计不太正确,方便给一下序列么? 导致扩出来的PCR产物不是你想要扩增的目的基因。至于中间第二泳道出现了两条带,只能说明,你的产物不纯。第一条带没有说明你要么点样出了问题,要么是你的PCR引物不 ...

不好意思,序列不能提供。我从新设计了四对引物,跑胶结果依然不理想,目的片段150左右,跑出来600左右,无解了。
7楼2015-08-28 14:55:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Snow_amy

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
建议你设计引物的时候除了要扩增的片段外,上下游各加3kb的序列,这样设计出来的非特异性会少很多~
8楼2015-08-29 15:11:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

爱起点

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by Snow_amy at 2015-08-29 15:11:07
建议你设计引物的时候除了要扩增的片段外,上下游各加3kb的序列,这样设计出来的非特异性会少很多~

怎么加序列,全部长度不到1kb
9楼2015-08-29 21:20:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 爱起点 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 3/150 2026-08-08 03:47 by 6vVgjDL4CnGu
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 3/150 2026-08-08 03:27 by 6vVgjDL4CnGu
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
信息提示
请填处理意见