24小时热门版块排行榜    

查看: 794  |  回复: 3

顾钻研

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助,怎样才能做好细菌DGGE图 已有2人参与

本人正在做细菌DGGE,但是出来的图条带模糊一片,而且跑不开,细菌PCR扩增条带都是很亮的,我做的胶是20%-40%,90v电泳12h,染色20min,求助为什么跑出来的图如下面这样呢?请各位大神指点指点。。。。。。

求助,怎样才能做好细菌DGGE图
1.PNG


求助,怎样才能做好细菌DGGE图-1
2.PNG
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shanliwademen

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
顾钻研: 金币+3 2015-08-13 14:44:36
根据你的描述和从图上看,主要存在两个问题,一是胶不合适,主要是不同浓度变性剂的胶没有混成梯度,而是电泳条件不合适。所以建议如下,1,如果变性剂是用的尿素,请用30%和60%的胶,而且要事先用红蓝胶模拟配胶确保变性梯度均匀,2,请用,105伏电压10小时电泳。同时注意两个小问题,1,保证电泳液恒温,如果电泳4小时后电泳液温度上升太高会出现彗星泳道,2,微量上样器点样是不飘不穿无气泡。当然我以上所说是认为你pcr的DNA是没问题的,但看你的pcr结果我还是不放心,建议下次加对照。上述为鄙人拙见,如有不妥之处请批评指正。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2015-08-13 01:29:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

顾钻研

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by shanliwademen at 2015-08-13 01:29:16
根据你的描述和从图上看,主要存在两个问题,一是胶不合适,主要是不同浓度变性剂的胶没有混成梯度,而是电泳条件不合适。所以建议如下,1,如果变性剂是用的尿素,请用30%和60%的胶,而且要事先用红蓝胶模拟配胶确保 ...

我之前做过40%-60%的胶。110v电压10小时,出现的带也是模糊一片,我自己也认为是我做胶的问题,你说的红蓝胶模拟配胶是怎样做的,我们实验室没听说有人这样做过,所以我还不知道怎么做?还有我的PCR扩增,有哪里不好吗?我看不出来,指教一下?
3楼2015-08-13 14:44:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨夜不爱学

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我最近也在做细菌dgge啊,摸索中,我感觉你的pcr条带有拖尾,可能是引物特异性不好,另外DGGE感觉你的胶的梯度太小,35%-65%常见,我用的是35—55%,为保证肉眼可见的确定胶的梯度,可以在高浓度胶中加入dye sloution 。配方的话在仪器的menu中都有。
4楼2015-08-19 10:08:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 顾钻研 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-29 21:22 by 4qO8zhfjr2AX
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-29 18:15 by 4FFAWE8HcgUD
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-29 17:31 by 4FFAWE8HcgUD
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-29 17:22 by 4FFAWE8HcgUD
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 14:03 by jCd0dEvKHShX
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:51 by jCd0dEvKHShX
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:29 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 11:18 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 9/450 2026-08-29 09:59 by jklily
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见