24小时热门版块排行榜    

查看: 784  |  回复: 3

顾钻研

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助,怎样才能做好细菌DGGE图 已有2人参与

本人正在做细菌DGGE,但是出来的图条带模糊一片,而且跑不开,细菌PCR扩增条带都是很亮的,我做的胶是20%-40%,90v电泳12h,染色20min,求助为什么跑出来的图如下面这样呢?请各位大神指点指点。。。。。。

求助,怎样才能做好细菌DGGE图
1.PNG


求助,怎样才能做好细菌DGGE图-1
2.PNG
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shanliwademen

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
顾钻研: 金币+3 2015-08-13 14:44:36
根据你的描述和从图上看,主要存在两个问题,一是胶不合适,主要是不同浓度变性剂的胶没有混成梯度,而是电泳条件不合适。所以建议如下,1,如果变性剂是用的尿素,请用30%和60%的胶,而且要事先用红蓝胶模拟配胶确保变性梯度均匀,2,请用,105伏电压10小时电泳。同时注意两个小问题,1,保证电泳液恒温,如果电泳4小时后电泳液温度上升太高会出现彗星泳道,2,微量上样器点样是不飘不穿无气泡。当然我以上所说是认为你pcr的DNA是没问题的,但看你的pcr结果我还是不放心,建议下次加对照。上述为鄙人拙见,如有不妥之处请批评指正。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2015-08-13 01:29:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

顾钻研

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by shanliwademen at 2015-08-13 01:29:16
根据你的描述和从图上看,主要存在两个问题,一是胶不合适,主要是不同浓度变性剂的胶没有混成梯度,而是电泳条件不合适。所以建议如下,1,如果变性剂是用的尿素,请用30%和60%的胶,而且要事先用红蓝胶模拟配胶确保 ...

我之前做过40%-60%的胶。110v电压10小时,出现的带也是模糊一片,我自己也认为是我做胶的问题,你说的红蓝胶模拟配胶是怎样做的,我们实验室没听说有人这样做过,所以我还不知道怎么做?还有我的PCR扩增,有哪里不好吗?我看不出来,指教一下?
3楼2015-08-13 14:44:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨夜不爱学

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我最近也在做细菌dgge啊,摸索中,我感觉你的pcr条带有拖尾,可能是引物特异性不好,另外DGGE感觉你的胶的梯度太小,35%-65%常见,我用的是35—55%,为保证肉眼可见的确定胶的梯度,可以在高浓度胶中加入dye sloution 。配方的话在仪器的menu中都有。
4楼2015-08-19 10:08:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 顾钻研 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +31 医学老男孩 2026-08-13 68/3400 2026-08-15 23:19 by 医学老男孩
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +12 archvillain 2026-08-15 23/1150 2026-08-15 20:47 by foyo404
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
信息提示
请填处理意见