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落木778

铜虫 (小有名气)

[求助] 有什么软件或者网站找出基因组的全部酶切位点? 已有8人参与

大家都知道酶切位点具有特异性,已知一个物种的基因组序列,我需要得到基因组的所有酶切位点,用什么方法查找?既快捷又一目了然
请教大家这个问题的目的是:本人已经提取了该物种的基因组,但我想获得碎裂的基因组,大约200bp,酶切是不是最好的一个方法,是否还有其他的方法?
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 落木778 at 2015-08-12 08:52:38
DNA片段化仪好像一般的实验室都没有,效果虽好,却没办法做咯...

多问问看其他单位是否有DNA片段化仪,比你酶切的方法靠谱。或者有超声波破碎仪也许也能试试,应该有相关资料介绍方法。
11楼2015-08-12 23:55:10
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查看全部 14 个回答

pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
找一个好一点的搜索,然后输入关键词 NEB cutter
行至水穷处,坐看云起时
2楼2015-08-11 12:14:22
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ch854355011

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
3楼2015-08-11 12:32:32
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jinxuan0904

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
NEB CUTTER 非常好!
4楼2015-08-11 13:55:01
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