24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 6024  |  回复: 13

落木778

铜虫 (小有名气)

[求助] 有什么软件或者网站找出基因组的全部酶切位点? 已有8人参与

大家都知道酶切位点具有特异性,已知一个物种的基因组序列,我需要得到基因组的所有酶切位点,用什么方法查找?既快捷又一目了然
请教大家这个问题的目的是:本人已经提取了该物种的基因组,但我想获得碎裂的基因组,大约200bp,酶切是不是最好的一个方法,是否还有其他的方法?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
找一个好一点的搜索,然后输入关键词 NEB cutter
行至水穷处,坐看云起时
2楼2015-08-11 12:14:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ch854355011

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
3楼2015-08-11 12:32:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

jinxuan0904

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
NEB CUTTER 非常好!
4楼2015-08-11 13:55:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用一种或少数酶酶切不一定能获得200bp均一的片段,因为基因组中酶切位点并不均匀,建议用DNA片段化仪,按照需要的片段大小进行超声波破碎,又快效果又好。
5楼2015-08-11 18:39:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

落木778

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ch854355011 at 2015-08-11 12:32:32
http://nc2.neb.com/NEBcutter2/
neb cutter

谢谢
6楼2015-08-12 08:50:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

落木778

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by stone2239 at 2015-08-11 18:39:49
用一种或少数酶酶切不一定能获得200bp均一的片段,因为基因组中酶切位点并不均匀,建议用DNA片段化仪,按照需要的片段大小进行超声波破碎,又快效果又好。

DNA片段化仪好像一般的实验室都没有,效果虽好,却没办法做咯
7楼2015-08-12 08:52:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cm14704019

至尊木虫 (知名作家)

primer5不知可否?

[ 发自小木虫客户端 ]
8楼2015-08-12 09:18:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ruofei89

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我一般上这个网站http://www.addgene.org/analyze-sequence/
直接输入序列,提交会自动分析所有酶切位点
9楼2015-08-12 11:57:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

人车

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我是用Vector NTI 里面可以添加酶切位点 至于要都要200 bp大小的 是不是有些难度啊
10楼2015-08-12 14:41:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 落木778 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qs8kylt1wr 2026-05-01 3/150 2026-05-03 07:22 by jmr1kibhvw
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qs8kylt1wr 2026-05-01 4/200 2026-05-03 07:19 by jmr1kibhvw
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qs8kylt1wr 2026-05-01 3/150 2026-05-03 06:34 by jmr1kibhvw
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 3/150 2026-05-03 06:04 by jmr1kibhvw
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 d8tbypao1q 2026-05-01 4/200 2026-05-03 05:49 by w5idbsc3mz
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 3/150 2026-05-03 05:07 by jmr1kibhvw
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 4/200 2026-05-03 04:34 by w5idbsc3mz
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 4/200 2026-05-03 04:19 by w5idbsc3mz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 4/200 2026-05-03 03:51 by w5idbsc3mz
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 4/200 2026-05-03 03:49 by w5idbsc3mz
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 k17zww5nna 2026-05-01 4/200 2026-05-03 02:06 by w5idbsc3mz
[考博] 考博 +4 Eternitf 2026-04-29 4/200 2026-05-02 16:10 by yejenny
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qs8kylt1wr 2026-05-01 3/150 2026-05-02 15:36 by zahslv263y
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 3/150 2026-05-02 14:21 by zahslv263y
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 3/150 2026-05-02 14:06 by zahslv263y
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k17zww5nna 2026-05-01 3/150 2026-05-02 09:36 by dz7y1p1i98
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k17zww5nna 2026-05-01 5/250 2026-05-02 09:21 by dz7y1p1i98
[有机交流] 一个化合物的合成路线:CAS:367929-02-0 名称:8β-乙烯基雌二醇 50+4 zhquanbing 2026-04-28 4/200 2026-04-30 22:45 by zyqchem
[考博] 中国地质大学(北京)博士招生补录,数理学院材料科学与工程专业和材料与化工专业 +3 liuxh329 2026-04-29 3/150 2026-04-30 15:42 by 顺利毕业zs
[基金申请] 收到国自然专家邀请后几年才会有本子送过来评 +3 barley5 2026-04-30 3/150 2026-04-30 14:58 by aspect3000
信息提示
请填处理意见