24小时热门版块排行榜    

查看: 6195  |  回复: 13

落木778

铜虫 (小有名气)

[求助] 有什么软件或者网站找出基因组的全部酶切位点? 已有8人参与

大家都知道酶切位点具有特异性,已知一个物种的基因组序列,我需要得到基因组的所有酶切位点,用什么方法查找?既快捷又一目了然
请教大家这个问题的目的是:本人已经提取了该物种的基因组,但我想获得碎裂的基因组,大约200bp,酶切是不是最好的一个方法,是否还有其他的方法?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
找一个好一点的搜索,然后输入关键词 NEB cutter
行至水穷处,坐看云起时
2楼2015-08-11 12:14:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ch854355011

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
3楼2015-08-11 12:32:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

jinxuan0904

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
NEB CUTTER 非常好!
4楼2015-08-11 13:55:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用一种或少数酶酶切不一定能获得200bp均一的片段,因为基因组中酶切位点并不均匀,建议用DNA片段化仪,按照需要的片段大小进行超声波破碎,又快效果又好。
5楼2015-08-11 18:39:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

落木778

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ch854355011 at 2015-08-11 12:32:32
http://nc2.neb.com/NEBcutter2/
neb cutter

谢谢
6楼2015-08-12 08:50:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

落木778

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by stone2239 at 2015-08-11 18:39:49
用一种或少数酶酶切不一定能获得200bp均一的片段,因为基因组中酶切位点并不均匀,建议用DNA片段化仪,按照需要的片段大小进行超声波破碎,又快效果又好。

DNA片段化仪好像一般的实验室都没有,效果虽好,却没办法做咯
7楼2015-08-12 08:52:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cm14704019

至尊木虫 (知名作家)

primer5不知可否?

[ 发自小木虫客户端 ]
8楼2015-08-12 09:18:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ruofei89

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我一般上这个网站http://www.addgene.org/analyze-sequence/
直接输入序列,提交会自动分析所有酶切位点
9楼2015-08-12 11:57:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

人车

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我是用Vector NTI 里面可以添加酶切位点 至于要都要200 bp大小的 是不是有些难度啊
10楼2015-08-12 14:41:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 落木778 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +5 苏东坡二世 2026-08-23 5/250 2026-08-27 10:39 by 炜雨
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 面上合作单位盖章 +3 ssyjh 2026-08-27 3/150 2026-08-27 09:59 by 阿拉贡aragon
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +4 a089 2026-08-26 5/250 2026-08-27 09:24 by Howard28
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 02:01 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 科研孤儿太难了 +21 我4大白菜 2026-08-20 22/1100 2026-08-26 11:29 by nlgza
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
请填处理意见