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有什么软件或者网站找出基因组的全部酶切位点?
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落木778
铜虫
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专业: 生物化学
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]
有什么软件或者网站找出基因组的全部酶切位点?
已有8人参与
大家都知道酶切位点具有特异性,已知一个物种的基因组序列,我需要得到基因组的所有酶切位点,用什么方法查找?既快捷又一目了然
请教大家这个问题的目的是:本人已经提取了该物种的基因组,但我想获得碎裂的基因组,大约200bp,酶切是不是最好的一个方法,是否还有其他的方法?
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2015-08-11 11:33:17
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jinxuan0904
木虫
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专业: 结构化学
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pennchem
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注册: 2012-11-21
专业: 生物大分子结构与功能
管辖:
生物科学
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找一个好一点的搜索,然后输入关键词 NEB cutter
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行至水穷处,坐看云起时
2楼
2015-08-11 12:14:22
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ch854355011
新虫
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注册: 2014-10-20
专业: 基因表达调控与表观遗传学
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http://nc2.neb.com/NEBcutter2/
neb cutter
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2015-08-11 12:32:32
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stone2239
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注册: 2011-10-04
性别: GG
专业: 植物生理与生化
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用一种或少数酶酶切不一定能获得200bp均一的片段,因为基因组中酶切位点并不均匀,建议用DNA片段化仪,按照需要的片段大小进行超声波破碎,又快效果又好。
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5楼
2015-08-11 18:39:49
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