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Stephanie丽

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何得到一段DNA序列的反向序列 已有4人参与

求助各位大神,PCR后得到的序列是否具有方向性?方向是由什么来决定的?具体是这样的,我PCR了一段基因序列,但是我现在需要把它颠倒过来,就是变成反向,不是反向互补,因为我需要把它跟另外一个片段反着连接起来,就是本来是ab和cd连接,但是我现在需要把ab和dc连接,有没有人知道该怎么做啊!!!!!!
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Tama二等兵

新虫 (初入文坛)

用同尾酶,或者平端连接啊
2楼2015-07-30 19:59:20
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gqyscnc

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你搞清楚,基因互补是配对的基础,你的片段多长啊,你想反向配对,不知目的何在?这不是那么容易的!
3楼2015-07-30 22:38:58
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yufeiwaner

新虫 (小有名气)

你说的是ab和cd互补吧?现在要变成ab和dc互补?听起来好像是听天书
4楼2015-07-31 10:22:33
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yufeiwaner

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
要是想得到单链,不太长的话,直接合成呗。让基因公司别把5'和3'弄错
5楼2015-07-31 10:24:21
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yangjingjing

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

反向互补有个网页版的
http://www.91bio.com/SMS2/rev_comp.html
努力打败一切
6楼2015-08-03 10:58:00
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Morlend

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

如果是5'和3'完全颠倒过来(就如同把整个序列左右镜面颠倒那样),那大概就需要重新合成了,PCR恐怕解决不了,不过不明白你为什么要这样做,因为密码子是三个一组的,颠倒过来就没有意义了呀?
如果说的是让基因换一个方向表达,正义链和反义链互换的同时碱基序列颠倒(把序列180°旋转),那个不用多虑,你的基因片段就可以用,方向是给人看的而已,参考snapgene软件工具栏中的view--flip sequence功能。
至于你说的ab和dc连接,我姑且理解为,你在设计引物时理解错了基因表达的方向,把引物设计反了,基因的末端设计在了启动子一侧,前端设计在了终止子的方向。如果你做的是酶切连接或者无缝克隆,那两端的连接位点是特异的,重新设计引物做一次PCR就好了。
7楼2021-01-07 17:08:03
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