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追风的人偶

木虫 (小有名气)

呢喃的歌声

[求助] 电泳Marker分子量的归属问题 已有1人参与

蛋白样品为Aβ1-42,单体分子量为4.5 KD。
凝胶用的是Tricine-SDS-PAGE,三层胶,厚度1.5 mm,自己配的。
(图1)电泳条件是70V,跑了大约15h,怕时间久了温度太高,所以用了冰浴。
显色方案是银染,用的碧云天的快速银染试剂盒,显色时间大概在10 min左右。

Marker用的分别是Thermo的26616和26632(图2):其中26616是预染的,我用它来观察蛋白泳动的情况,标注的分子量应该没问题,染色前70 KD的条带是红色的,10 KD的条带是绿色的;26632是非预染的。

问题是26632指示的分子量该怎么对照:
1、如果按(图1)中(1)标注的,10、15、25 KD的条带跟26616的能对上,但是3.4和5 KD的条带不见了,是什么原因造成的?
((图3)是猜想它俩跑出去了,换了1 mm厚度的胶来跑,70 V,4 .5h,好像下面也干干净净的,啥都没有)。

2、如果按(图1)中(2)标注的,从下往上依次标注,要怎么解释两种marker指示的分子量差别那么大?

之前没怎么接触过电泳,最近才开始做,重复了好多次,都是差不多的结果,很困惑。请大家给咱指导一下,先谢谢了!

电泳Marker分子量的归属问题
P50710-222121_副本_副本.jpg


电泳Marker分子量的归属问题-1
P50722-145623_副本.jpg


电泳Marker分子量的归属问题-2
P50715-195720_副本.jpg
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错过了的就是永远。
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LG123456789

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

70V跑15h,,,
我们一般是100V-140V跑1-2h。
你银染显色的时间有点太长了吧,背景好深。
PS:本人新手,不对以上言论负责。
再PS:同制备Aβ寡聚体中,4度孵育后离心,上清里啥都没了。。
4楼2015-09-14 15:28:00
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查看全部 6 个回答

追风的人偶

木虫 (小有名气)

呢喃的歌声

自己顶一下

[ 发自小木虫客户端 ]
错过了的就是永远。
2楼2015-07-23 08:40:05
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追风的人偶

木虫 (小有名气)

呢喃的歌声

老师让我按(2)所标示的来看,我再摸索摸索孵育条件。
错过了的就是永远。
3楼2015-08-03 10:23:49
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追风的人偶

木虫 (小有名气)

呢喃的歌声

引用回帖:
4楼: Originally posted by LG123456789 at 2015-09-14 15:28:00
70V跑15h,,,
我们一般是100V-140V跑1-2h。
你银染显色的时间有点太长了吧,背景好深。
PS:本人新手,不对以上言论负责。
再PS:同制备Aβ寡聚体中,4度孵育后离心,上清里啥都没了。。

我后来发现是我的负极buffer配错了,才跑不动。换了正确的跑,70V跑到夹层胶,再换120V跑到底,一共用了3个多小时。

第二块胶背景深是因为试剂盒里的银溶液用光了,就用了别人配的。平常我用乙醇:醋酸:水=50:10:40固定过夜后,用试剂盒染出来的背景是很浅的。

我现在在摸孵育的时间,文献上的孵育时间只能做参考。打算加了F12后4度孵育,在不同时间点取样,不离心,直接变性,看看它们的分子量分布,再决定下一步怎么处理它。

你说的啥都没有,我没遇到过,我之前即使是buffer配错了,也是有条带的。等我结果出来了以后,在接着讨论吧。寡聚体不好做,共勉!

发自小木虫Android客户端
错过了的就是永远。
5楼2015-09-15 14:42:24
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