24小时热门版块排行榜    

查看: 2205  |  回复: 16

朱庆平

铜虫 (小有名气)

[求助] 真核生物是否有基因没有内含子 已有7人参与

本人从NCBI找到一目的基因mRNA的全序列,分别根据该序列的CDS从起始密码子和终止密码子处设计了一对上下游引物;再根据该基因的5’和3’段UTR设计了一对引物;以基因组DNA为模板,进行了两轮扩增,扩增结果见图;第一轮扩增基本上无结果,而第二轮扩增以第一轮的PCR反应液为模板,使用了与第一轮同样的引物,条带清晰,请问为什么会这样呢?另外,从第二轮PCR的电泳图上可以看出,以DNA为模板,根据CDS序列设计的引物进行的PCR条带的大小为1300左右,这个大小与mRNA的CDS大小1331bp基本上一致的,那么问题是这个基因没有内含子吗?该基因是个核基因,其编码产物定位于质体或叶绿体上。另外,在UTR部分设计的上下游引物经两轮扩增出了两条带,500bp和800bp,加在一起也就1300bp左右,这与mRNA的1500bp全序列有出入,这又是为什么呢?

真核生物是否有基因没有内含子
DNA-FAD6-M3-C-U-第一轮-7.21.jpg


真核生物是否有基因没有内含子-1
DNA-FAD6-M3-U-C-第二轮-7.21.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-22 17:40:29
真核生物中确实有些基因没有内含子的,碰到过两个这样的基因。
2楼2015-07-22 16:45:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

朱庆平

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lxj341401 at 2015-07-22 16:45:59
真核生物中确实有些基因没有内含子的,碰到过两个这样的基因。

你是做实验碰到的吗?还是看的文献啊?
3楼2015-07-22 18:03:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 朱庆平 at 2015-07-22 18:03:40
你是做实验碰到的吗?还是看的文献啊?...

做酶基因克隆表达时。
4楼2015-07-23 09:23:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

朱庆平

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lxj341401 at 2015-07-23 09:23:19
做酶基因克隆表达时。...

额,你觉得有没有真核基因DNA的intron位于UTR与CDS之间的呢?
5楼2015-07-23 10:51:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏夜微风

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
酿酒酵母就有很多基因没有内含子。
还未成熟,就已老去!
6楼2015-07-23 13:10:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

朱庆平

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 夏夜微风 at 2015-07-23 13:10:02
酿酒酵母就有很多基因没有内含子。

我这个是植物基因,其产物定位于质体上。
7楼2015-07-23 13:22:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

growlywolf

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
5楼: Originally posted by 朱庆平 at 2015-07-23 10:51:24
额,你觉得有没有真核基因DNA的intron位于UTR与CDS之间的呢?...

很正常。UTR区域本身就包含好几个内含子的情况并不奇怪
8楼2015-07-23 20:31:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

growlywolf

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 朱庆平 at 2015-07-23 13:22:57
我这个是植物基因,其产物定位于质体上。...

根据内共生学说,质体的基因组更接近于原核生物。
9楼2015-07-23 20:33:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小泓杨

捐助贵宾 (初入文坛)

初出茅庐

【答案】应助回帖


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-25 22:14:42
首先,咱们是根据宏观的电泳来看待微观的问题。这样不可避免的出现不可解释的现象,还有,第一轮扩增都没有扩增出来,这本身就有问题。还有,这是你从NCBI中查到的额,而不是自己做的,即便是自己做的,有差错很正常。最好怎么样?多测几遍序,然后综合。如果实在不行,放弃吧。
中国的-boy 是一个缺心眼子!
10楼2015-07-25 19:52:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 朱庆平 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:47 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +4 布布和一二 2026-08-08 7/350 2026-08-08 14:29 by 布布和一二
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:01 by oEVWOejN9taj
[基金申请] fileCode有新解读? +8 Tide man 2026-08-08 16/800 2026-08-08 09:59 by Tide man
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 3/150 2026-08-08 03:47 by 6vVgjDL4CnGu
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +4 yang182083 2026-08-06 6/300 2026-08-07 12:43 by 虫友是什么虫
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
信息提示
请填处理意见