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gaussian输入文件的内坐标输出形式 已有2人参与
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如题 如何输出这样形式的内坐标形式，如图1  图1.png 如何输出这样形式的内坐标形式，如图2  图2.png 本人刚刚接触gaussian，希望各位能够伸出援手为我指点迷津 谢谢了 |
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2楼2015-06-09 20:16:07
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今天刚刚回看了我收藏的帖子，正好有这个。 解决办法很简单，先把体系保存成.mol等其它格式，然后载入之，再保存成Gaussian输入文件，就会看到内坐标都用字母表示了： http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=740 |
3楼2015-06-09 21:07:51
4楼2015-06-10 09:44:35
小范范1989
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5楼2015-06-10 09:47:46
6楼2015-06-10 21:50:19
小范范1989
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你说的这个就是固定坐标，固定原子等等的计算了。 我当时保存的方式，如下，可能有的不是你想要的，我都告诉你 1:第一种方式 如何固定原子？ 下例：固定C原子 %chk=G:\ByHand\wqb\aaaa.chk # hf/3-21g opt Title Card Required 0 1 C -1 -3.09344800 0.33849017 -0.10614458 H 0 -2.73679357 -0.67031983 -0.10614458 H 0 -2.73677516 0.84288836 -0.97979608 H 0 -4.16344800 0.33850336 -0.10614458 C -1 -2.49343761 1.18701049 1.36354954 H 0 -2.84849396 2.19638358 1.36257202 H 0 -2.85170672 0.68374206 2.23719943 H 0 -1.42343942 1.18530381 1.36452830 第二种方式： %chk=CC-nei.chk %nprocs=4 %mem=500MB #p popt=Z-matrix b3lyp/6-31++g(d,p) CC-nei 0 1 C C 1 B1 C 2 B2 1 A1 C 3 B3 2 A2 1 D1 C 4 B4 3 A3 2 D2 C 1 B5 2 A4 3 D3 H 1 B6 2 A5 3 D4 H 2 B7 1 A6 6 D5 H 4 B8 3 A7 2 D6 H 5 B9 4 A8 3 D7 C 3 B10 2 A9 1 D8 C 11 B11 3 A10 2 D9 C 12 B12 11 A11 3 D10 H 12 B13 11 A12 3 D11 C 13 B14 12 A13 11 D12 H 13 B15 12 A14 11 D13 C 15 B16 13 A15 12 D14 C 17 B17 15 A16 13 D15 C 17 B18 15 A17 13 D16 C 18 B19 17 A18 15 D17 H 18 B20 17 A19 15 D18 C 19 B21 17 A20 15 D19 H 19 B22 17 A21 15 D20 C 20 B23 18 A22 17 D21 H 20 B24 18 A23 17 D22 H 22 B25 19 A24 17 D23 N 6 B26 1 A25 2 D24 H 27 B27 6 A26 1 D25 H 27 B28 6 A27 1 D26 N 24 B29 20 A28 18 D27 H 30 B30 24 A29 20 D28 H 30 B31 24 A30 20 D29 C 11 B32 3 A31 2 D30 C 33 B33 11 A32 3 D31 H 34 B34 33 A33 11 D32 H 34 B35 33 A34 11 D33 H 34 B36 33 A35 11 D34 C 33 B37 11 A36 3 D35 H 38 B38 33 A37 11 D36 H 38 B39 33 A38 11 D37 H 38 B40 33 A39 11 D38 Variables: B1 1.39370799 B2 1.41176505 B3 1.41555254 B4 1.38753303 B5 1.40195866 B6 1.08763752 B7 1.08155848 B8 1.08463875 B9 1.08765955 B10 1.47032862 B11 1.36535296 B12 1.44075840 B13 1.08403083 B14 1.36531962 B15 1.08407298 B16 1.47026272 B17 1.41142612 B18 1.41589478 B19 1.39405283 B20 1.08155672 B21 1.38724033 B22 1.08462316 B23 1.40161703 B24 1.08763388 B25 1.08768096 B26 1.39771883 B27 1.01089689 B28 1.01088284 B29 1.39796680 B30 1.01105695 B31 1.01109956 B32 1.54320339 B33 1.54938658 B34 1.09251356 B35 1.09455834 B36 1.09261458 B37 1.55284558 B38 1.09440369 B39 1.09213146 B40 1.09212387 A1 122.39528108 A2 115.47160631 A3 122.63260222 A4 121.02998930 A5 119.34527153 A6 117.20646121 A7 119.62124932 A8 119.50650097 A9 124.21746928 A10 125.65909414 A11 110.91876638 A12 126.16633091 A13 110.91342861 A14 122.91141955 A15 125.67048183 A16 124.24321098 A17 120.27991429 A18 122.40133547 A19 120.42011133 A20 122.62391958 A21 119.59147077 A22 121.01593815 A23 119.31139446 A24 119.53663309 A25 121.33292354 A26 115.78558447 A27 115.83128468 A28 121.36201536 A29 115.71980115 A30 115.70833203 A31 126.77264050 A32 110.36714158 A33 111.73741015 A34 109.85456242 A35 111.67907911 A36 109.58756260 A37 109.77468548 A38 111.79178912 A39 111.82753142 D1 0.28236328 D2 -0.42300153 D3 -0.08111574 D4 179.73326452 D5 179.95245940 D6 179.12372108 D7 -179.65215261 D8 179.99286088 D10 178.73799204 D11 -1.38533892 D12 0.04394899 D13 179.89922117 D14 -178.95148233 D15 -176.49974830 D17 179.73683283 D18 0.02627222 D19 -179.75585801 D20 0.53157711 D21 0.11084008 D22 179.83263245 D23 -179.55333565 D24 177.30802299 D25 23.48411845 D26 158.05846965 D27 177.24560739 D28 23.95077303 D29 158.14034262 D30 -4.32269191 D31 -60.44131396 D32 -176.03499727 D33 -56.55917664 D34 62.91543016 D35 65.15994974 D36 55.64476610 D37 175.13930164 D38 -63.87476511 Constants: D9 160.770000000000 D16 -12.9600000000000 |
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