24小时热门版块排行榜    

查看: 2055  |  回复: 24
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lele6134569

金虫 (正式写手)

走天山

[求助] 转录组测序 已有6人参与

本人做羊草耐盐性研究,但是,羊草的很多基因都还是未知的,本人想做相关基因的在盐胁迫下的定量表达,与植物生理数据相结合。想做个转录组测序,是不是就可以,用转录组测序的数据进行定量表达了呢?转录组测序的数据,又该如何使用呢?请求高人指点。
回复此楼
积极向上
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

曹欣

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
16楼: Originally posted by yhz0626 at 2015-06-10 22:47:12
质控不是在组装之前完成吗,需要去除接头片段和低质量片段,组装之后也要质控吗?
...

拼接出来几万到上百万的序列,你一条条做blast要做到何年何月

[ 发自小木虫客户端 ]
19楼2015-06-13 08:42:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 25 个回答

mayunhui

新虫 (正式写手)

我也不是很清楚,不是至少应该弄清整个基因组么?
书到用时方恨少
5楼2015-06-03 14:20:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
转录组测序可以帮助你获得你所测试组织或处理条件下的基因表达丰度。通过这个测序,可以获得相关的拼接序列,公司一般会帮你做好注释,你可以筛选出你需要的基因序列进行定量PCR的检测。
6楼2015-06-03 16:56:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhz0626

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
将de novo组装的数据用blastx 进行比对注释,还有go,kegg分析等,应该能够找到相关的基因

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2015-06-03 17:11:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 19:55 by lXgU0RvNTDC9
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 9/450 2026-08-23 18:46 by lXgU0RvNTDC9
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 h4CP7TrQR8Lg 2026-08-22 3/150 2026-08-23 16:30 by lXgU0RvNTDC9
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 5/250 2026-08-23 14:33 by KM5EcsNQRBPn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 6/300 2026-08-23 14:21 by KM5EcsNQRBPn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 炎黄贵胄 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见