应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 转录组测序
51/1返回列表
查看: 1657  |  回复: 24
查看全部回帖@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lele6134569

金虫 (正式写手)

走天山

[求助] 转录组测序已有6人参与

本人做羊草耐盐性研究，但是，羊草的很多基因都还是未知的，本人想做相关基因的在盐胁迫下的定量表达，与植物生理数据相结合。想做个转录组测序，是不是就可以，用转录组测序的数据进行定量表达了呢？转录组测序的数据，又该如何使用呢？请求高人指点。
回复此楼

» 猜你喜欢
积极向上
1楼2015-06-03 11:05:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhz0626

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
将de novo组装的数据用blastx 进行比对注释，还有go,kegg分析等，应该能够找到相关的基因

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
7楼2015-06-03 17:11:56
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhz0626

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
13楼: Originally posted by 曹欣 at 2015-06-09 22:05:31
行家
...

见笑了，我是新手，很新很新的手

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
14楼2015-06-10 07:58:34
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhz0626

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
15楼: Originally posted by 曹欣 at 2015-06-10 20:53:49
拼接出来的数据直接Blast数据量太大，也不可信，应该进行严格的质控。做个差异分析什么的。
...

质控不是在组装之前完成吗，需要去除接头片段和低质量片段，组装之后也要质控吗？

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
16楼2015-06-10 22:47:12
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhz0626

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
19楼: Originally posted by 曹欣 at 2015-06-13 08:42:27
拼接出来几万到上百万的序列，你一条条做blast要做到何年何月
...

本地化的blastx比对，将要与比对的基因组或者蛋白质组下载到本地，输入比对命令，都是批量的出结果，或者用blast2go软件，数据分析一条龙

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下(1人) 回复此楼
20楼2015-06-13 13:46:03
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lele6134569 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭