应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 转录组测序
251/3返回列表123下一页
查看: 1970  |  回复: 24
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lele6134569

金虫 (正式写手)

走天山

[求助] 转录组测序 已有6人参与

本人做羊草耐盐性研究，但是，羊草的很多基因都还是未知的，本人想做相关基因的在盐胁迫下的定量表达，与植物生理数据相结合。想做个转录组测序，是不是就可以，用转录组测序的数据进行定量表达了呢？转录组测序的数据，又该如何使用呢？请求高人指点。
回复此楼

» 猜你喜欢
积极向上
1楼 2015-06-03 11:05:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

yhz0626

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
19楼: Originally posted by 曹欣 at 2015-06-13 08:42:27
拼接出来几万到上百万的序列，你一条条做blast要做到何年何月
...

本地化的blastx比对，将要与比对的基因组或者蛋白质组下载到本地，输入比对命令，都是批量的出结果，或者用blast2go软件，数据分析一条龙

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下(1人) 回复此楼
20楼2015-06-13 13:46:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
先通过测序的RPKM或者RPKM值找到差异基因，再看注释的结果中哪些差异基因与你说的盐胁迫有关，一般公司都会给你做拼接，注释，差异基因筛选，如果你的样品多，还可以做表达量关联分析，同时，可以下载蛋白互作数据库，看一下，看一下差异或者相关目的基因的网络图。找到关键的一批基因，或者最好能定位到关键的代谢通路上，再通过qpcr验证，基本上是这么个思路！
赞一下(1人) 回复此楼
21楼2015-06-13 15:34:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

syhorchid
★
lele6134569(金币+1): 谢谢参与
2楼2015-06-03 11:14:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dmbb
★
lele6134569(金币+1): 谢谢参与
3楼2015-06-03 11:28:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tzynew
★
lele6134569(金币+1): 谢谢参与
4楼2015-06-03 12:50:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mayunhui

新虫 (正式写手)
我也不是很清楚，不是至少应该弄清整个基因组么？
赞一下 回复此楼
书到用时方恨少
5楼2015-06-03 14:20:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
转录组测序可以帮助你获得你所测试组织或处理条件下的基因表达丰度。通过这个测序，可以获得相关的拼接序列，公司一般会帮你做好注释，你可以筛选出你需要的基因序列进行定量PCR的检测。
赞一下 回复此楼
6楼2015-06-03 16:56:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhz0626

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
将de novo组装的数据用blastx 进行比对注释，还有go,kegg分析等，应该能够找到相关的基因

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
7楼2015-06-03 17:11:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mtw922
8楼2015-06-05 10:02:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wenzhitian
9楼2015-06-05 11:40:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

百客

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
转录组测序可以处理这个问题，您有解决的方法没有？
赞一下 回复此楼
10楼2015-06-05 14:31:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lele6134569 的主题更新
251/3返回列表123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 l7k6xnh0yc 2026-05-14 5/250 2026-05-17 19:39 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 cjf4bx70cj 2026-05-14 7/350 2026-05-17 18:49 by Equinoxhua
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 v9tggjlwd0 2026-05-15 5/250 2026-05-17 18:39 by Equinoxhua
[考博] 光量子物理方向 博士招生 1人（2026.09） +3 sandyworld 2026-05-15 4/200 2026-05-17 14:38 by sandyworld
[考博] 西南大学考核制博士 +5 lijunjie84 2026-05-11 8/400 2026-05-17 14:21 by 鹅鹅鹅鹅aaa
[考博] 26/27博士推荐 +3 1木头人13949 2026-05-13 3/150 2026-05-17 09:41 by YuY66
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 xx7gd5zq4e 2026-05-15 7/350 2026-05-17 07:58 by 11n4dfd8yn
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 l7k6xnh0yc 2026-05-14 8/400 2026-05-17 07:26 by 11n4dfd8yn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 cjf4bx70cj 2026-05-14 7/350 2026-05-17 06:55 by 11n4dfd8yn
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 ky2p12rrjj 2026-05-15 5/250 2026-05-17 01:10 by ue3ir18jc3
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 3/150 2026-05-17 00:45 by ue3ir18jc3
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:35 by ue3ir18jc3
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:25 by ue3ir18jc3
[有机交流] 求助2，4-二氯-5-嘧啶甲醛的合成方法 20+3 光吃不拉 2026-05-14 6/300 2026-05-16 19:46 by Equinoxhua
[有机交流] 求有机合成大神指点三硫酸乙烯酯（CAS：2793408-99-6）的合成路线 30+3 Leekmid 2026-05-13 10/500 2026-05-16 16:37 by czyzsu
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 l7k6xnh0yc 2026-05-14 6/300 2026-05-16 11:29 by h3oerqvkv9
[硕博家园] 申请博士 +3 呃?呃 2026-05-15 3/150 2026-05-16 11:01 by a4742549
[文学芳草园] 裁员滚滚，退居二线 +4 J_wei 2026-05-10 4/200 2026-05-16 10:52 by zh10246
[基金申请] 青C资助名额大幅增加！ +11 西葫芦炒鸡蛋 2026-05-13 15/750 2026-05-15 14:36 by ambravo
[考博] 26应届毕业生考博求助 +3 wo一定上岸 2026-05-13 3/150 2026-05-14 21:47 by 明海天涯
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭