应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 转录组测序
251/3返回列表123下一页
查看: 1782  |  回复: 24
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lele6134569

金虫 (正式写手)

走天山

[求助] 转录组测序 已有6人参与

本人做羊草耐盐性研究，但是，羊草的很多基因都还是未知的，本人想做相关基因的在盐胁迫下的定量表达，与植物生理数据相结合。想做个转录组测序，是不是就可以，用转录组测序的数据进行定量表达了呢？转录组测序的数据，又该如何使用呢？请求高人指点。
回复此楼

» 猜你喜欢
积极向上
1楼 2015-06-03 11:05:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

yhz0626

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
19楼: Originally posted by 曹欣 at 2015-06-13 08:42:27
拼接出来几万到上百万的序列，你一条条做blast要做到何年何月
...

本地化的blastx比对，将要与比对的基因组或者蛋白质组下载到本地，输入比对命令，都是批量的出结果，或者用blast2go软件，数据分析一条龙

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下(1人) 回复此楼
20楼2015-06-13 13:46:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
先通过测序的RPKM或者RPKM值找到差异基因，再看注释的结果中哪些差异基因与你说的盐胁迫有关，一般公司都会给你做拼接，注释，差异基因筛选，如果你的样品多，还可以做表达量关联分析，同时，可以下载蛋白互作数据库，看一下，看一下差异或者相关目的基因的网络图。找到关键的一批基因，或者最好能定位到关键的代谢通路上，再通过qpcr验证，基本上是这么个思路！
赞一下(1人) 回复此楼
21楼2015-06-13 15:34:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

syhorchid
★
lele6134569(金币+1): 谢谢参与
2楼2015-06-03 11:14:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dmbb
★
lele6134569(金币+1): 谢谢参与
3楼2015-06-03 11:28:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tzynew
★
lele6134569(金币+1): 谢谢参与
4楼2015-06-03 12:50:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mayunhui

新虫 (正式写手)
我也不是很清楚，不是至少应该弄清整个基因组么？
赞一下 回复此楼
书到用时方恨少
5楼2015-06-03 14:20:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
转录组测序可以帮助你获得你所测试组织或处理条件下的基因表达丰度。通过这个测序，可以获得相关的拼接序列，公司一般会帮你做好注释，你可以筛选出你需要的基因序列进行定量PCR的检测。
赞一下 回复此楼
6楼2015-06-03 16:56:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhz0626

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
将de novo组装的数据用blastx 进行比对注释，还有go,kegg分析等，应该能够找到相关的基因

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
7楼2015-06-03 17:11:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mtw922
8楼2015-06-05 10:02:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wenzhitian
9楼2015-06-05 11:40:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

百客

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
转录组测序可以处理这个问题，您有解决的方法没有？
赞一下 回复此楼
10楼2015-06-05 14:31:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lele6134569 的主题更新
251/3返回列表123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 08工学调剂 +13 用户573181 2026-03-20 18/900 2026-03-25 22:00 by zbssa
[考研] 332求调剂 +5 032500 2026-03-25 5/250 2026-03-25 21:33 by Aoyijiang
[考研] 316求调剂 +8 梁茜雯 2026-03-19 8/400 2026-03-25 20:33 by 热情沙漠
[考研] 一志愿中南大学化学学硕0703总分337求调剂 +7 niko- 2026-03-22 7/350 2026-03-25 20:14 by qingfeng258
[考研] 化学调剂一志愿上海交通大学336分-本科上海211 +3 小鱼爱有机 2026-03-25 3/150 2026-03-25 20:13 by qingfeng258
[考研] 食品专硕 一志愿双一流 328 +3 xiaom99 2026-03-21 4/200 2026-03-24 21:20 by lailaisimei
[有机交流] 有机合成求助 20+3 FENGSHUJEI 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:31 by 88817753
[考研] 一志愿哈工大，085400，320，求调剂 +3 gdlf9999 2026-03-24 3/150 2026-03-24 10:08 by 搏击518
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 350求调剂 +6 weudhdk 2026-03-19 6/300 2026-03-23 15:47 by tangyuan0840221
[考研] 一志愿070300浙大化学358分，求调剂！ +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 一志愿华中农业071010，总分320求调剂 +5 困困困困坤坤 2026-03-20 6/300 2026-03-22 17:41 by hxsm
[考研] 319求调剂 +4 小力气珂珂 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:53 by ColorlessPI
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 22 350 本科985求调剂，求老登收留 +3 李轶男003 2026-03-20 3/150 2026-03-21 13:28 by 搏击518
[考研] 求调剂 +3 白QF 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:12 by zhukairuo
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭